HIV - Interpretazione del test di resistenza FENOTIPO GENOTIPO Fold-resistance CUT-OFF Biologico Clinico (??) PREDIZIONE risposta alla terapia.

Presentazione sul tema: "HIV - Interpretazione del test di resistenza FENOTIPO GENOTIPO Fold-resistance CUT-OFF Biologico Clinico (??) PREDIZIONE risposta alla terapia."— Transcript della presentazione:

1 HIV - Interpretazione del test di resistenza FENOTIPO GENOTIPO Fold-resistance CUT-OFF Biologico Clinico (??) PREDIZIONE risposta alla terapia

2 HIV - Interpretazione del test di resistenza Il rapporto fra genotipi e fenotipi eseguiti è >1000 Chi richiede un genotipo è anche chi: Conosce i dati precedenti del paziente Imposta la terapia Segue la risposta alla terapia

3 Dal genotipo alla risposta al trattamento FENOTIPO GENOTIPO Fold-resistance CUT-OFF Biologico Clinico (??) PREDIZIONE risposta alla terapia

4 Progetto Genotipo-Risposta Obiettivo Alimentare un grande database di correlazione genotipo - follow-up attraverso cui allestire un sistema predittivo della risposta alla terapia basato su modelli di autoapprendimento (es. reti neurali) Competenze richieste Infettivologia Virologia Statistica Matematica Informatica

5 Modello di un possibile sistema di Risposta Virtuale basato sul genotipo Dati immessi GENOTIPO RT 41L 210W 215Y GENOTIPO PR 10I 63P 77I 90M HIV RNA 4.3 log CD4 330 Trattamento AZT, D4T+DDI+EFV rIsposta attesa a x mesi Regime 1 - 1.5 log +126 CD4 Regime 2 - 1.3 log +102 CD4..….. ELABORAZIONE INPUTOUTPUT Utente remoto Server

6 Dal genotipo alla risposta Fasi di sviluppo FaseStato 1Scelta dei parametri necessariCompletata 2Raccolta e centralizzazione datiIn corso 3Set-up del software (interfaccia utente, raccolta input, generazione output) e allestimento web In corso

7 Progetto Genotipo-Risposta Parametri necessari per linserimento del record nel database Paziente ID Genotipo (SEQUENZA) HIV RNA CD4 Terapie precedenti Terapia nuova HIV RNA a 3, 6, 12 mesi CD4 a 3, 6, 12 mesi Ogni nuovo genotipo avvia un nuovo follow-up di 12 mesi Regime terapia Data inizio Data fine Causa fine Dati al baseline Dati pregressi Dati follow-up

8 Centri inclusi nel progetto (aprile 2003) Alcuni centri della regione Tutti i centri della regione Dati di ~2500 pazienti attualmente disponibili

9 Progetto Genotipo-Risposta Partecipanti Laboratori e Servizi di Virologia Ancona, Pisa, Prato, Siena Cliniche di Malattie Infettive Toscana, Umbria, Marche, altri centri in Abruzzo, Veneto, Emilia, Lazio, Lombardia Informa srl Gestione hardware e software Elaborazioni dati GlaxoSmithKline Unrestricted educational grant

10 ARCA (Antiretroviral Resistance Cohort Analysis) www.hivarca.net Archivio on-line per il reparto (andamento dei propri pazienti, informazioni globali sulla propria popolazione di pazienti) Dati statistici pubblici sulla resistenza agli antiretrovirali Interpretazione del genotipo attraverso lalgoritmo aggiornato di AntiRetroScan Supporto per studi sulla farmacoresistenza che necessitano di una grande mole di dati (es. Progetto Genotipo-Risposta) Centralizzazione dati per eventuale trasferimento su programmi internazionali pubblici relativi allo studio e al monitoraggio della farmacoresistenza agli antiretrovirali.

11 ARCA Proprietà dei dati e possibilità di analisi Per ogni centro è designato un referente La proprietà dei dati resta del singolo centro che li fornisce Qualsiasi proposta di studio sui dati del database è sottoposta ai singoli centri e lo studio è effettuato sul sottoinsieme dei dati provenienti dai centri che approvano lo studio Qualsiasi studio approvato che sia oggetto di pubblicazione deve riportare, assieme agli ideatori e autori dello studio, il Gruppo Collaborativo come autore Lintento principale di ARCA è lo sviluppo di servizi ad accesso PUBBLICO via web I servizi allestiti interrogano il database ma non possono essere prelevati i dati