Uso del Codice in E.coli e in H.sapiens

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CARATTERIZZAZIONE DI UN GENE CANDIDATO
Transcript della presentazione:

Uso del Codice in E.coli e in H.sapiens Seconda Posizione Prima Posizione Terza Posizione

Componenti e regolatori del flusso d'informazione genetica DNA, mRNA, proteine polimerasi tRNA e ribosomi proteine regolatrici

L’RNA è l’intermediario tra il DNA e le proteine Autoradiografa di una cellula esposta a uridina radioattiva per 15 min Autoradiografa di una cellula esposta a uridina radioattiva per 15 min e successivamente a uridina non radioattiva per 80 min

Definizioni: genoma trascrittoma proteoma

Dimensioni di genomi:

Composizione del genoma eucariotico

Paradosso del valore C Eccesso di DNA rispetto alla complessità Variazioni di valore C per complessità simili

Struttura del genoma eucariotico Sequenze ripetute Altri DNA non codificanti Introni DNA codificante

Composizione del genoma umano

Sequenze ripetute nel genoma umano Uniche (1-10 volte) Maggior parte dei geni circa 40% Geni reiterati in tandem (rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.) Mediamente ripetute (da centinaia a migliaia di volte) Alcune sequenze regolative 40-50% intersperse Alcune sequenze a funzione speciale (centromeri, origini, etc.) Altamente ripetute (da decine di migliaia DNA satelliti, sequenze semplici a milioni di volte) 5-10%

geni per: rRNA (300) tRNA (1300) 5S RNA (2000) istoni (20) sequenze ripetute intersperse sequenza Alu: 300 nt (x 1.000.000) sequenze semplici o satelliti: 2-10 nt (x 2-100 copie in tandem x 1-100 blocchi interspersi)

Il DNA non ripetitivo è solo una parte del genoma

Composizione del genoma Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.

La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire con l'aumentare della grandezza del genoma

Relazione tra DNA e mRNA: procarioti Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Relazione tra DNA e mRNA: eucarioti

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Definizioni Esoni: sequenze rappresentate nell'RNA maturo Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006