Allungamento e terminazione

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ESERCITAZIONE BIOINFORMATICA
Transcript della presentazione:

Allungamento e terminazione

I promotori procariotici

La“Pribnow box” nei promotori di E.coli fd ..TGCTTCTGACTATAATAGACAGGGTAAAGACCTGATTTTTGA T7 A3 AAGTAAACACGGTACGATGTACCACATGAAACGACAGTGAGTCA T7 A2 AGTAACATGCAGTAAGATACAAATCGCTAGGTAACACTAGCAG. Lac-UV- 5 GCTTCCGGCTCGTATAATGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA. l P ACCTCTGGCGGTGATAATGGTTGCATGTACTAAGGAGGTTG... R l P L ACCACTGGCGGTGATACTGAGCACATCAGCAGGACGCACTGAC. Tyr tRNA ..CGTCATTTGATATGATGCGCCCCGCTTCCCGATAAGGGAGCA Lac w.t. GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAA. Consenso -10 T80A95T45A60A50T96 5-9 bp A/G T82T84G78A65C54A45 Consenso -35

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Il promotore tipico di E.coli è costituito da tre componenti: sequenza consenso -35 sequenza consenso -10 sito d’inizio TATAAT TTGACA 5-9 basi 16-19 basi -10 -35 Sequenza -35 Pribnow box Sito di inizio della trascrizione +1

Promotori procariotici

Regolazione della trascrizione

Fattori Sigma di E.coli

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Vari fattori Sigma regolano le fasi d’infezione del fago SPO1

Fattori trans-agenti Elementi cis-agenti

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Struttura dell’operone

Controllo negativo Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Controllo positivo

Controllo negativo e positivo

Metabolismo del lattosio Glucosio Galattosio Legame b-galattosidico b-galattosidasi

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Sequenza del promotore lac

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Operone lattosio

Operone triptofano

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Controllo negativo

Controllo positivo

Operone arabinosio di E.coli (controllo positivo)

Operone arabinosio

Proteina CAP (CRP)

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CAP interagisce con la polimerasi

Regolazione positiva NtrC è un regolatore positivo che non agisce tramite "reclutamento" ma tramite modificazione allosterica della polimerasi

Tipi di regolazione Corepressore Corepressore

Regolazione dell'operone lattosio