PROTEINE DI SECREZIONE CITOSOL LUME RER 1 N CITOSOL LUME RER 2 N CITOSOL LUME RER 3

PROTEINE DI MEMBRANA TIPO II N 1 N 2 N 3 C CITOSOL LUME RER CITOSOL

PROTEINE DI MEMBRANA TIPO II N 1 N 2 N 3 C CITOSOL LUME RER CITOSOL

Proteine dotate di una sequenza segnale- ancoraggio interna

L’orientamento degli aa carichi del peptide segnale determina la topologia della proteina: TIPO 2

PROTEINE DI MEMBRANA TIPO I N 1 N 2 C 3 N CITOSOL LUME RER CITOSOL

Traslocazione delle proteine TM di tipo 1

La disposizione degli aa carichi nel peptide segnale determina la topologia della proteina: TIPO 1

PROTEINE MULTIPASSO N 1 N 2 C N 3 CITOSOL LUME RER CITOSOL LUME RER

Traslocazione di proteine multipasso

idrofobico citosol idrofilico lume amminoacido N°

GIORNATA DI SCIOPERO NELL’UNIVERSITA’ 23 aprile 2004 GIORNATA DI SCIOPERO NELL’UNIVERSITA’ PERCHE’? urgenza di intervenire sull’università con legge ordinaria, non con legge-delega COSA NON VA NELLA LEGGE-DELEGA? abolizione della distinzione tra tempo pieno e definito uso di compensi integrativi e fondi delle supplenze abolizione del ruolo dei ricercatori istituzione di contratti quinquennali perdita del ruolo centrale dell’attività di ricerca

PROTEINE CON ANCORA GPI (glicosilfosfatidilinositolo) estremo COOH della proteina GPI

MODIFICAZIONI DELLE PROTEINE NEL RER 1. GLICOSILAZIONE (asparagine) 2. FORMAZIONE DI PONTI DISOLFURO 3. OLIGOMERIZZAZIONE 4. RIMODELLAMENTO DELLE CATENE OLIGOSACCARIDICHE 5. ARCHITECTURAL EDITING QUALITY CONTROL

OT ASN-X-SER ASN-X-THR 1. GLICOSILAZIONE (asparagine) OLIGOSACCARIL TRANSFERASI RIBOFORINA I RIBOFORINA II PROTEINA 48kDa ASN-X-SER ASN-X-THR

H O N-C-C-X- Ser Thr H CH2 ASPARAGINA C-O NH OLIGOSACCARIDE

Man P GlcNAc 2 5 9 RER CITOSOL DOLICOLO Glu 3

Biosintesi del DOLICOLO-pirofosforil OLIGOSACCARIDE

Asn X Ser/Thr = N-Acetilglucosamina GlcNAc = Mannnosio Man = Galattosio Gal = Acido sialico NANA = Glucosio Glu

Asn X Ser/Thr RER Asn X Ser/Thr GOLGI

2. FORMAZIONE DI PONTI DISOLFURO PDI (PROTEINA DISOLFURO ISOMERASI) AMBIENTE NON RIDUCENTE IDROLISI DI ATP

3. OLIGOMERIZZAZIONE ALCUNE PROTEINE SONO COSTITUITE DI PIU’ SUBUNITA’. LE SUBUNITA’ SI ASSOCIANO NEL RER. L’OLIGOMERIZZAZIONE E’ SPESSO INDISPENSABILE PER USCIRE DAL RER.

4. RIMODELLAMENTO DELLE CATENE OLIGOSACCARIDICHE LE 3 MOLECOLE DI GLUCOSIO VENGONO RIMOSSE DALL’OLIGOSACCARIDE PRIMA CHE LA PROTEINA ESCA DAL RER.

Elaborazione degli oligosaccaridi N-Linked nel RER

5. ARCHITECTURAL EDITING QUALITY CONTROL NEL RETICOLO ENDOPLASMATICO SONO PRESENTI NUMEROSE PROTEINE CHE SVOLGONO FUNZIONI DI CHAPERONI O CHAPERONINE. QUESTE PROTEINE: 1. INTERVENGONO NEL RIPIEGAMENTO DELLE PROTEINE IN TRANSITO. 2. IMPEDISCONO CHE PROTEINE NON CORRETTAMENTE RIPIEGATE ESCANO DAL RER. ESEMPI: BiP - CALNEXINA - CALRETICULINA - HSP70

2001

Ripiegamento di HA nel lume del RER: chaperonine

GLICOSILAZIONE E RIPIEGAMENTO

DEGRADAZIONE DI PROTEINE DEL RER

SINTESI DI LIPIDI SUL RE

COME ESCONO DAL RER LE PROTEINE IN TRANSITO? BULK FLOW COME VENGONO TRATTENUTE LE PROTEINE RESIDENTI? SEGNALI DI RITENZIONE NEL LUME DEL RER: KDEL C-TERMINALE SEGNALI DI RITENZIONE NELLA MEMBRANA: KKXX XXRR KXKXX C-TERMINALE N-TERMINALE

LA SEQUENZA KDEL E’ UN SEGNALE DI RITENZIONE NEL RER PDI ratto QKAVKDEL topo QKAVKDEL uomo QKAVKDEL pollo QKAVKDEL BiP ratto DTSEKDEL topo DTSEKDEL uomo DTAEKDEL pollo EAAEKDEL CALRETICULINA coniglio RRQAKDEL topo PAQAKDEL

IgM (Immmunoglobuline M) (Segnali sono contenuti nella porzione COOH terminale - negli ultimi 20 aa) ..........NVS..........CY IL GRUPPO TIOLO DELLA CISTEINA E’: segnale di ritenzione - assemblaggio - degradazione REM - plasmacellula > 3000 Ab x secondo

TRA RER E APPARATO DI GOLGI ESISTE UN COMPARTIMENTO INTERMEDIO IC ERGIC SALVAGE COMPARTMENT CGN EXOSOME

DAL RER AL GOLGI proteina secretoria recettore del RER proteina del RER DAL GOLGI AL RER

TRASPORTO AL GOLGI bloccato da brefeldina A microtubulo bloccato da nocodazolo RITORNO DAL GOLGI