PROGETTO “HITECH2000” Supporters : Annamaria Muoio Affiliation : TRIGRID, INFN - CT Meeting : TRIGRID - CHECKPOINT 2 Catania, 30.06.2006

Supporter e Partner responsabili INFN – sez. CT AnnaMaria Muoio (annamaria.muoio@ct.infn.it) Partner responsabili HITECH2000 SRL Via Giorgio Arcoleo, 4 95030 Gravina di Catania - Catania Ing.re Lo Nigro (lonigro@hitech2000.it) Ing.re Pucci (pucci@hitech2000.it) Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Generalità sul progetto Applicazione Per una Simulazione numerica di flusso, occorre tener conto di determinati caratteristiche fluidodinamiche per esempio: Compressibilità/Incompressibilità del fluido; Scambio termico e di massa ( attraverso: Convezione naturale e forzata; Radiazione; Fluido a più componenti; tutte e tre in % variabili) Reazioni chimiche e combustione (miscele del gas e del liquido, controllo della cinetica di reazione e/o dalla miscelazione turbolenta, etc.) Flusso a più fasi (p.e. liquido/particelle, gas/particelle, gas/fluido) Resistenza al flusso (dovuta principalmente ad oggetti porosi)  Oggetti in movimento (generanti o meno percolato, con velocità piccole per evitare presenza di vortici) Scopo Esecuzione delle simulazioni monitorando la variazione dei parametri caratteristici. Aspetti computazionali, risorse necessarie Compilazione statica Tempo di trasferimento trascurabile rispetto all’elaborazione Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Porting dell’applicazione La versione attuale del middle-ware e' adeguata L'applicazione consta di sottomissione, del controllo dei job ed del recupero dei file di uscita Interazione con l'utente Batch E' richiesto il controllo dell'avanzamento dei job Controllo d’accesso Un solo utente Sicurezza a livello ACL per il singolo utente Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Stato attuale del progetto Stato dell’arte Al momento il software OpenFoam versione 1.3 risiede su di un area dedicata su cui ho potuto espletare delle simulazioni. unico jdl variano alcuni parametri caratteristici di ingresso al momento sono recuperabili file di calcoli matriciali In futuro sono da eseminarte File di immagini statiche File per simulazioni runtime Analisi di pre e post trattamento dei job Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

casi disponibili OpenFoam 1.3 [amaria@alifarm23 tutorials]$ ls Allclean buoyantFoam coodles financialFoam laplacianFoam potentialFoam RunFunction sonicLiquidFoam twoPhaseEulerFoam Allrun buoyantSimpleFoam dieselFoam finiteAreaFoam lesInterFoam rasInterFoam scalarTransportFoam sonicTurbFoam XiFoam Alltest channelOodles dnsFoam icoDyMFoam mhdFoam rhopSonicFoam settlingFoam stressedFoam Xoodles boundaryFoam CleanFunctions electrostaticFoam icoFoam nonNewtonianIcoFoam rhoSonicFoam simpleFoam stressFemFoam bubbleFoam contactStressFoam engineFoam interFoam oodles rhoTurbFoam sonicFoam turbFoam casi disponibili Esempio di un flusso laminare incomprimibile in una cavità Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

OpenFoam 1.3 /*---------------------------------------------------------------------------*\ | ========= | | | \\ / F ield | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox | | \\ / O peration | Version: 1.3 | | \\ / A nd | Web: http://www.openfoam.org | | \\/ M anipulation | | \*---------------------------------------------------------------------------*/ Exec : blockMesh . cavity Date : Jun 28 2006 Time : 15:45:52 Host : alifarm23.ct.infn.it PID : 3586 Root : /home/amaria/OpenFOAM/OpenFOAM-1.3/tutorials/icoFoam Case : cavity Nprocs : 1 Create time …………… Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

OpenFoam 1.3 Starting time loop Time = 0.005 Mean and max Courant Numbers = 0 0 BICCG: Solving for Ux, Initial residual = 1, Final residual = 2.96338e-06, No Iterations 8 BICCG: Solving for Uy, Initial residual = 0, Final residual = 0, No Iterations 0 ICCG: Solving for p, Initial residual = 1, Final residual = 7.55402e-07, No Iterations 35 time step continuity errors : sum local = 5.03809e-09, global = 6.6009e-20, cumulative = 6.6009e-20 ICCG: Solving for p, Initial residual = 0.523591, Final residual = 9.72352e-07, No Iterations 34 time step continuity errors : sum local = 1.07766e-08, global = -6.48675e-19, cumulative = -5.82666e-19 ExecutionTime = 0.01 s ClockTime = 0 s Time = 0.01 Mean and max Courant Numbers = 0.0514108 0.585722 BICCG: Solving for Ux, Initial residual = 0.148584, Final residual = 7.15711e-06, No Iterations 6 BICCG: Solving for Uy, Initial residual = 0.256618, Final residual = 8.94127e-06, No Iterations 6 ICCG: Solving for p, Initial residual = 0.379232, Final residual = 3.38648e-07, No Iterations 34 time step continuity errors : sum local = 3.15698e-09, global = -1.09684e-19, cumulative = -6.9235e-19 ICCG: Solving for p, Initial residual = 0.286937, Final residual = 5.99637e-07, No Iterations 33 time step continuity errors : sum local = 6.08774e-09, global = 5.86554e-19, cumulative = -1.05796e-19 ExecutionTime = 0.02 s ClockTime = 0 s …………………………………………. Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

ParaView Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

ParaView Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

ParaView Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

ParaView Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Submit-jobtest-out test01/icoFoam/resetFixedWallsScr test01/machinefile Running on: grid036.ct.infn.it ************************************* /*---------------------------------------------------------------------------*\ | ========= | | | \\ / F ield | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox | | \\ / O peration | Version: 1.2 | | \\ / A nd | Web: http://www.openfoam.org | | \\/ M anipulation | | \*---------------------------------------------------------------------------*/ Exec : blockMesh /home/gilda044/globus- tmp.grid036.22300.0/WMS_grid036_022770_https_3a_2f_2fgrid004.ct.infn.it_3a9000_2f5_5fJbUkHiwmxSpF7dACi_5foQ/ test01/icoFoam cavity Date : Nov 09 2005 Time : 13:58:39 Host : grid036.ct.infn.it PID : 23165 Root : /home/gilda044/globus- tmp.grid036.22300.0/WMS_grid036_022770_https_3a_2f_2fgrid004.ct.infn.it_3a9000_2f5_5fJbUkHiwmxSpF7dACi_5foQ/ test01/icoFoam Case : cavity Nprocs : 1 Create time………… Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

PROGETTO “Mammo” Supporters : Marcello Iacono Manno, Annamaria Muoio Affiliation : TRIGRID, INFN - CT Meeting : TRIGRID - CHECKPOINT 2 Catania, 30.06.2006

Genius-mammo Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

GUI-Mammo Visualizzare immagini mammografiche DICOM relative a paziente scelto dal DB Realizzare query semplici o complesse sui dati relativi alle immagini DICOM per i pazienti con determinate patologie o caratteristiche morfologiche Visualizzare immagini mammografiche DICOM relative a paziente scelto dal DB Inserire, pubblicare su SE e registrare su LFC i nuovi pazienti ed inserire i relativi metadati delle immagini DICOM Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Genius -Mammo Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Genius-Mammo Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Prossimi Steps Genius-Mammo Prossimi Campi da inserire Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Prossimi Steps Genius-Mammo Prossimi Campi da inserire Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Prossimi Steps Genius-Mammo Prossimi Campi da inserire Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Prossimi Steps Genius-Mammo Prossimi Campi da inserire Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Prossimi Steps Genius-Mammo Prossimi Campi da inserire Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Prossimi Steps Genius-Mammo Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

PROGETTO “Isospin” Supporters : Marcello Iacono Manno, Annamaria Muoio Affiliation : TRIGRID, INFN - CT Meeting : TRIGRID - CHECKPOINT 2 Catania, 30.06.2006

Genius-isospin Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006

Genius-isospin Catania, 2nd Trigrid CheckPoint Meeting, 30.06.2006