Cominciano le indagini La scena del crimine Cominciano le indagini
Polimorfismi di lunghezza In queste zone del DNA, particolari sequenze delle basi ACGT vengono ripetute più volte determinando nelle varie forme alleliche, lunghezze variabili del tratto medesimo. A seconda della lunghezza della sequenza ripetuta sono ulteriormente suddivisi in:
Polimorfismi del DNA Variazioni interindividuali della composizione o della lunghezza di specifici tratti di DNA che permettono, tramite analisi molecolare, di distinguere ciascun singolo individuo (tranne i gemelli monovulari)
Satelliti da 1 a diverse migliaia di basi VNTR da 9 a 100 basi Microsatelliti o STR da 1 a sei basi La classificazione attuale, utilizza dei numeri che indicano il numero delle ripetizioni presenti in ogni forma allelica
(Variable Number of Tandem Repeats) VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) Ripetizioni in tandem di 15-30 basi di DNA all’interno di specifici loci del genoma Un individuo sarà omozigote per uno specifico locus se i due alleli contengono lo stesso numero di ripetizioni, sarà eterozigote se, al contrario, il numero di ripetizioni nei due alleli è diverso Il numero di queste ripetizioni può variare da individuo a individuo, producendo dei frammenti di DNA di dimensioni diverse
Short Tandem Repeats (STRs) AATG 7 repeats 8 repeats the repeat region is variable between samples while the flanking regions where PCR primers bind are constant Homozygote = both alleles are the same length Heterozygote = alleles differ and can be resolved from one another
Short Tandem Repeats (STRs) Sono come delle impronte digitali Alto grado di polimorfismo ed alta capacità informativa Utilizzati nei paternity testing e nelle analisi forensi
Short Tandem Repeats (STRs) AATG 7 repeats 8 repeats the repeat region is variable between samples while the flanking regions where PCR primers bind are constant Homozygote = both alleles are the same length Heterozygote = alleles differ and can be resolved from one another
Principali applicazioni dei polimorfismi del DNA Medicina legale Paternity testing Identificazione di autori di reati Identificazione di vittime di reati o sinistri Trapianti di midollo osseo Analisi di linkage
esempio Il polimorfismo D12S391 (cr12). Ogni persona possiede una coppia di cr 12, uno ereditato dalla madre e uno dal padre. Su ognuno di questi cr si trova il D12. Sono stati identificati 13 alleli diversi designati dal numero 14 al 26 Ogni individuo sia uomo che donna avrà sui due cromosomi una di queste possibili forme o alleli Alcune combinazioni alleliche sono più frequenti
È possibile due individui o due tracce tra loro in base alla coppia di alleli del polimorfismo D12 che esse mostreranno in base all’analisi I classici sistemi gruppo-ematici (AB0 ed Rh) prevedono solo poche forme alternative
Sistema AB0 Nella popolazione italiana 40% gruppo A 11% gruppo B 4% gruppo AB 45% gruppo 0
La scelta degli STR per l’indagine forense è dovuta da: Marcatori che vengono ereditati dai genitori senza che subiscano variazioni (salvo eventi rari) Trattandosi di ripetizioni corte è molto più probabile travarli intatti su materilali biologici molto degradati o antichi È possibile analizzare più loci in contemporanea il che favorisce l’uso di sistemi automatici di analisi Sono altamente polimorfi presentando ogni STR un elevato numero di alleli
DNA mitocondriale Organuli citoplasmatici: mitocondri Doppia elica circolare (16.569 paia di basi) singola copia.Il contenuto di mtDNA per cellula è di circa 100 copie. L’analisi di questo DNA è molto sensibile e si può risalire ad un profilo anche da una singola cellula. Non sono noti STR ma in una regione d-loop sono presenti molti polimorfismi di sequenza.