Terminazione negli eucarioti

Slides:

Advertisements

Presentazioni simili

Lez 7 Processamento dell’RNA negli eucaroti: RNA splicing

Advertisements

SINTESI PROTEICA.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans Possono.

L’ordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA

Antiterminazione.

Esperimento che dimostra che U1 snRNA riconosce il sito di splicing al 5 mediante appaiamento di basi 1)Mutazioni al 5 ss inibiscono lo splicing 2)Mutazioni.

Definizioni: genoma trascrittoma proteoma.

Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005.

Terminazione negli eucarioti. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006.

Modificazioni dell’rRNA

trans-esterificazioni

Organizzazione del genoma Quanti geni? Quali geni? Quanti geni indispensabili?

Transcription termination RNA polymerase I terminates transcription at an 18 base terminator sequence. RNA polymerase III terminates transcription in poly(U)

Apparato di traduzione e sue componenti

Martedì 24 nov Bioinformatica Giovedì 26 nov Bio Mol.

I promotori procariotici. fd T7 A3 T7 A2 Lac-UV-5 P R P L Tyr tRNA Lac w.t. Consenso -10..TGCTTCTGACTATAATAGACAGGGTAAAGACCTGATTTTTGA AAGTAAACACGGTACGATGTACCACATGAAACGACAGTGAGTCA.

Strutture superiori del DNA

Ruolo degli introni nell’evoluzione (teoria del “mescolamento degli esoni”)

1. In una molecola di DNA a doppia elica, quale è il filamento complementare alla seguente sequenza ? 5'-TACGATCATAT-3’ A.3'-ATGCTAGTATA-5’ B.5'-TACGATCATAT-3’

Definizioni: genoma trascrittoma proteoma.

Uso del Codice in E.coli e in H.sapiens

Unità di ripetizione di diversi telomeri

COME LE CELLULE LEGGONO IL GENOMA:

Allungamento e terminazione

Siti di sostituzione e siti silenti

Strutture alternative del DNA

Regolazione generale della traduzione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Introni Assenti nei procarioti (qualche eccezione)

RNAi (meccanismo di difesa)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Antiterminazione.

Definizioni: genoma trascrittoma proteoma.

La regolazione genica negli eucarioti

Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Meccanismi per la replicazione delle estremità

Regolazione della traduzione

Controllo della replicazione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Struttura "modulare" degli attivatori

Strutture superiori del DNA

Martedì 21 nov ore Giovedì 23 nov ore Bioinformatica

Non-Stop Mediated Decay (NSMD)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Il superavvolgimento negativo

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006.

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

DNA elicasi e proteine destabilizzatrici dell’elica

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Patologie associate ad espansione di triplette

Terminazione negli eucarioti

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Complessi basali delle RNA polimerasi eucariotiche

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Transcript della presentazione:

Terminazione negli eucarioti

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

La poliadenilazione degli mRNA eucariotici

CPSF riconosce seq. AAUAAA CstF lega GU, stimola CFI, CFII endonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Maturazione (processamento) dell’RNA

mRNA

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

RNA ribosomale

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Modificazioni dell’rRNA Metilazione (55 lievito, 110 vertebrati) Pseudouridilazione (45 in lievito, 100 vertebrati)

snoRNP (small nucleolar RNP) Box C/D metilazione Box H/ACA pseudouridilazione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

trans-esterificazioni Tipi di splicing meccanismo simile Splicing nucleare Splicing di introni di tipo II Splicing di introni di tipo I Splicing di tRNA di lievito trans-esterificazioni spliceosoma autosplicing nucleasi e ligasi

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

trans-esterificazioni Tipi di splicing meccanismo simile Splicing nucleare Splicing di introni di tipo II Splicing di introni di tipo I Splicing di tRNA di lievito trans-esterificazioni spliceosoma autosplicing nucleasi e ligasi

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

snRNP nello spliceosoma U1 U2 U4/U6 U5

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006