Terminazione negli eucarioti

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Lez 7 Processamento dell’RNA negli eucaroti: RNA splicing

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SINTESI PROTEICA.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans Possono.

L’ordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA

Antiterminazione.

Esperimento che dimostra che U1 snRNA riconosce il sito di splicing al 5 mediante appaiamento di basi 1)Mutazioni al 5 ss inibiscono lo splicing 2)Mutazioni.

Modificazioni dell’rRNA

Organizzazione del genoma Quanti geni? Quali geni? Quanti geni indispensabili?

Transcription termination RNA polymerase I terminates transcription at an 18 base terminator sequence. RNA polymerase III terminates transcription in poly(U)

Apparato di traduzione e sue componenti

Martedì 24 nov Bioinformatica Giovedì 26 nov Bio Mol.

Strutture superiori del DNA

Definizioni: genoma trascrittoma proteoma.

Uso del Codice in E.coli e in H.sapiens

Unità di ripetizione di diversi telomeri

COME LE CELLULE LEGGONO IL GENOMA:

Allungamento e terminazione

Siti di sostituzione e siti silenti

Strutture alternative del DNA

Regolazione generale della traduzione

Introni Assenti nei procarioti (qualche eccezione)

RNAi (meccanismo di difesa)

Antiterminazione.

Definizioni: genoma trascrittoma proteoma.

La regolazione genica negli eucarioti

Meccanismi per la replicazione delle estremità

Regolazione della traduzione

Controllo della replicazione

Struttura "modulare" degli attivatori

Strutture superiori del DNA

Martedì 21 nov ore Giovedì 23 nov ore Bioinformatica

Non-Stop Mediated Decay (NSMD)

Il superavvolgimento negativo

DNA elicasi e proteine destabilizzatrici dell’elica

Patologie associate ad espansione di triplette

Terminazione negli eucarioti

Complessi basali delle RNA polimerasi eucariotiche

Transcript della presentazione:

Terminazione negli eucarioti

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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La poliadenilazione degli mRNA eucariotici

CPSF riconosce seq. AAUAAA CstF lega GU, stimola CFI, CFII endonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Maturazione (processamento) dell’RNA

mRNA

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RNA ribosomale

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Modificazioni dell’rRNA Metilazione (55 lievito, 110 vertebrati) Pseudouridilazione (45 in lievito, 100 vertebrati)

snoRNP (small nucleolar RNP) Box C/D metilazione Box H/ACA pseudouridilazione

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trans-esterificazioni Tipi di splicing meccanismo simile Splicing nucleare Splicing di introni di tipo II Splicing di introni di tipo I Splicing di tRNA di lievito trans-esterificazioni spliceosoma autosplicing nucleasi e ligasi

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trans-esterificazioni Tipi di splicing meccanismo simile Splicing nucleare Splicing di introni di tipo II Splicing di introni di tipo I Splicing di tRNA di lievito trans-esterificazioni spliceosoma autosplicing nucleasi e ligasi

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snRNP nello spliceosoma U1 U2 U4/U6 U5

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Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

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