L’esperienza pugliese di BioBOP Le reti Regionali: L’esperienza pugliese di BioBOP A.Paradiso Istituto Tumori, IRCCS, Bari

L’INTERVENTO “RETI DI LABORATORI PUBBLICI DI RICERCA-Regione Puglia” Accordo di Programma Quadro per la Ricerca (Delibera CIPE 35/2005 relativa alle risorse FAS per il periodo 2005 – 2008) Le linee d'intervento per il rafforzamento del sistema regionale dell'innovazione sono: Sostegno alle attività di sviluppo sperimentale e all'innovazione di processo e organizzativa delle PMI e aiuti alla nascita e sviluppo di piccole imprese innovative Rafforzamento del potenziale tecnologico e infrastrutturale della Regione

Domanda di innovazione del sistema produttivo Pugliese Medicina stratificata >>>>> personalizzata>>>>>precision Domanda di innovazione del sistema produttivo Pugliese Diagnostici: nuovi Biomarkers Biomedicale tecnologie innovative Farmacologico validazione clinico-analitica di targets Campioni biologici umani Informazione su aggressività clinica Caratterizzazione biologica Procedure ELSI standardizzate

Lifecycle of a Biospecimen Pre-acquisition Post Acquisition Antibiotics Other drugs Type of anesthesia Anesthesia duration Arterial clamp time Study Design SOP’s Equipment Cohort Definition Material Transfer Ethics Courtesy Peter Riegman Erasmus University and Marble Arch International Working Group on Human Specimen Biobanking for Biomedical Research Measure in Years Pre- Release Measure in Minutes Storage Media Storage Method Storage Temperature Quality Controls Pathology Review Disease Site Clinical Data Data Standards Acquisition Processing Time Temperature Fixation Agent Donor Consent Transport Receiving Storage Scientific Analysis Medical/ Surgical Procedures Restocking/ Destruction Release, Distribution Annotation Processing Quality Clinical Biobanking Medical Treatment Medical Research 4

BioBOP-BioBanca Oncologica Pugliese Network per l’utilizzo di tessuti oncologici controllati e caratterizzati per lo sviluppo di nuovi approcci diagnostici, farmacologici e biomedicali Unità di ricerca Responsabile 1: Istituto Tumori G Paolo II, IRCCS,Bari Dr A Paradiso 2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Univ Foggia Prof A Liso 3: Dip Fisiol Generale e Ambientale, Univ Bari Prof S Reshkin 4: Ist. Tecnologie Biomediche, CNR, Bari Prof G Pesole 5: Dip Fisiol Generale e Ambientale, Univ. Bari Prof S Cotecchia 6: IRCCS CSS, S. Giovanni Rotondo Prof V Fazio

Cod Progetto: 57 BioBOP-BioBanca Oncologica Pugliese Obiettivo della Rete -Sviluppo di una Infrastruttura di Risorse Biomolecolari per la Ricerca organizzate intorno ad una Cancer-Oriented-Biobank regionale. -Integrazione risorse biomolecolari e tecnologiche per caratterizzazione tessuti oncologici

Biobanca Regionale DataBase Tessuti Umani Caratterizzzazione Biologica Realtà Produttiva Uni FG- Ematologie CSS SGR IRCCS Tumori Bari BioBOP Biobanca Regionale DataBase UniBa ITBCNR

UO2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Fac UO2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Fac. Medicina e Chirurgia, Univ Foggia Prof Arcangelo Liso AutoMACS Pro Separator, Miltenyi

Dip. Bioscienze, Biotecnologie e Biofarmaceutica Università Bari Prof S Reshkin Prof S Cotecchia Microscopio confocale Targa del Confocale: BioBoP/Università Laser multi-fotoni Targa del multi-fotoni: BioBoP/Università

UO4: Ist. Tecnologie Biomediche, CNR, Bari Prof Graziano Pesole Dr. Apollonia Tullo 1. 2 1. Liquid Handler: 3 2. Digital PCR: 4 4. Contatore automatico di cellule: 3. Sistema di frammentazione a ultrasuoni:

UO6: IRCCS Casa Sollievo Sofferenza, S UO6: IRCCS Casa Sollievo Sofferenza, S. Giovanni Rotondo Prof V Fazio Dr P Parrella HT7900 Fast Real time PCR System (Life Technology). Sistema di PCR in Real Time dotato di blocco Low Density Array (LDA) che permette di analizzare fino a 380 diversi target precedentemente depositati su una apposita card. Conferendo allo strumento funzionalità di microarray a bassa densità.

Biobanca Istituto Tumori Bari Tessuti Umani Caratterizzzazione Biologica Realtà Produttiva Uni FG- Ematologie CSS SGR Biobanca Istituto Tumori Bari IRCCS Tumori Bari BioBOP UniBa ITBCNR

Biobanca Oncologica: il percorso dell’Istituto Tumori, IRCCS, Bari Struttura Biobanking dal 1988 Lab Recettori Ormonali e Cinetica Cellulare Biobanca Laboratorio Oncologia Sperimentale>> Certificazione ISO 9001 nel 2008 Biobanca Istituzionale 2009 Biobanca di interesse Regionale-BioBOP 2011 Responsabilità 2004: Italian Network Cancer Biobanks (NICAB): coordinamento 2008: Rete Italiana Biobanche Oncologiche (RIBBO): coordinamento 2009: EORTC Biobank WG co-chairman 2010: BBMRI Prototype Project, chairman Italian Cancer Biobanks 2012: BBMRI-ESFRI: member DG Committee Pubblicazioni>100 Special Issue Biopreservation&Biobanking, vol 9, n.2, 2011 (Guest Edt Paradiso A, Daidone MG, Riegman P)

Biobanca Istituto Tumori Bari: Le esigenze Dimensioni: Storage Biocampioni per Istituto Tumori Riferimento Regionale Performances Versatilità Different tissues Biomolecular Resource Centre Storage material of GMP Facility

BioBanca Istituzionale- BioBanca Oncologica di Riferimento Regionale Istituto Tumori G Paolo II IRCCS Bari Livello 1: Elaborazione dati Laboratorio manipolazione, aliquotaggio Laboratorio Produzione Derivati Ingresso n. 2 livelli, 280 mq Livello 2: Area Stocckaggio per Diagnostica/ricerca Criocontenitori, -80°C, -143°C,-173°C Area Stocckaggio Materiale terapeutico Criocontenitori,-143°C,-173°C, discesa

BioBanca Istituzionale Area Congelatori piano -1

1)Equipment Monitoring, Calibration, Maintenance, and Repair 2)Control of Biospecimen Collection Supplies 3)Biospecimen Quality Control Testing 4) Biosafety (Grizzle and Fredenburgh 2001)

BioBanca Istituzionale Specimen traceability: The Tissue Bank Project CERTIFICAZIONE BioBanca Istituzionale IRCCS Bari Clinical Pathology Storage

Biobanche tra presente e futuro Organizzazione-Gestione Standard Operating Procedures I Informed Consent. Equipment Monitoring, Calibration, Maintenance, and Repair Control of Biospecimen Collection Supplies (Disposables and Reagents) Biospecimen Identification and Labeling Biospecimen Collection and Processing Methods Storage and Retrieval Shipping and Receiving In-House Including Biospecimen Quality Control Testing Biospecimen Data Collection and Management (Informatics) Biosafety Training Security (OBBR-NCI, last Revision 2010)

Opportunità: BIOBANCA ISTITUZIONALE Istituto Tumori Bari Governance: Management Interno Rapporti con Providers-Rete BioBOP Rapporti con Stake-holders Sostenibilità/costi Barbareschi M (Pathologica, 2008) D’Agnolo G (CNSBBV, RIBBO, 2012) Clement B (JTM, 2014)

Clement B,JTM 2014

Outputs for a Biobank (Paradiso A, Hansson M, Nature Medicine, 2013) Make research - Scientific publication (BRIF) (Hofman V, ..Parodi B, et al Biopreserv Biobank. 2013; Utilization of biobank resources (underuse) (Paradiso A, Hansson M, Nature Medicine, 2013)

Punti di forza: BIOBANCA ISTITUZIONALE Istituto Tumori Bari Capacità di sostenere l’impresa (Call “Clusters tecnologici”) Sviluppare Ricerca (ONEV, Trials Clinici, BBMRI, Registro Tumori ) Cultura/Regolamentazione Biobanking a Livello Regionale

Accordo Conferenza permanente Stato-Regioni 25 Marzo 2009 “Regioni responsabili della individuazione/regolamentazione delle biobanche da certificare nel territorio di competenza” Rete biobanche Regione Liguria (delibera n.34 Giunta Regionale , 22 gennaio 2010) Rete biobanche Regione Campania (delibera n.39 Giunta Regionale 14 febbraio 2011) Rete Oncologica Lombarda (ROL) (Decreto n.10507,Novembre 2012. Linee Guida Regolamentazione Biobanche di Ricerca ) Regione Toscana (delibera n.974 del 25 novembre 2013) http://www.bbmri.it/regioni

Biobanca: sito web www.biobop.it Email: bancatessuti.oncologia@oncologico.bari.it Coord Scient. A Paradiso a.paradiso@oncologico.bari.it RUP GSalomone g.salomone@oncologico.bari.it BBMRI.IT ML Lavitrano www.bbmri.it