FUNZIONE DELLE PROTEINE Interazioni transitorie con altre molecole. LIGANDI: altre molecole anche proteiche. Il sito di legame è complementare ai ligandi per forma, dimensione, carica, idrofilia e idrofobicità. L’interazione è specifica e discriminante. Il sito di legame si può adattare al legante: adattamento indotto. Negli enzimi le interazioni sono forti e provocano/ facilitano reazioni chimiche. I ligandi diventano substrati che si legano nel sito catalitico o sito attivo.

MIOGLOBINA: L’ossigeno si lega al gruppo EME Porfirina Gruppo EME

Legame reversibile esempio mioglobina e emoglobina Gruppo prostetico: EME Per trasportare l’ossigeno che è poco solubile in acqua e quindi diffonde lentamente specialmente in grandi organismi.

q = P + L PL [PL] Ka = [P][L] [PL] Ka [L] = [P] siti di legame occupati q = totale dei siti di legame Ka[L][P] = Ka[L][P]+[P] Ka[L] = Ka[L]+1 [L] = [L]+_1_ Ka

INTERAZIONI TRA EME E MIOGLOBINA

Confronto tra le strutture della mioglobina e della subunità b dell’emoglobina Identicità di amminoacidi in solo 27 posizioni

Interazioni dominanti tra le subunità dell’emoglobina

Il legame dell’ossigeno all’emoglobina è di tipo cooperativo e provoca un notevole cambiamento di conformazione, si passa dallo stato T a quella R

Legame cooperativo dell’ossigeno L’emoglobina è una proteina allosterica

Varianti dell’emoglobina e malattie molecolari L’anemia a cellule falciformi Un unico amminoacdo è cambiato, valina al posto acido glutammico

Immuniglobuline

Proteine che provocano il movimento, Actina e miosina Filamenti spessi

b) ATP a) c) Pi e) d) ADP L’ATP saldamente legato è idrolizzato e avviene una modificazione conformazionale. ADP e Pi restano legati alla testa della miosina L’ATP si lega alla testa di miosina e causa la dissociazione dell’actina Filamento di actina ATP a) c) La testa della miosina si attacca al filamento di actina e il Pi viene rilasciato Filamento spesso di miosina Pi e) d) ADP Il rilascio del Pi innesca la generazione della “forza contrattile, una modificazione conformazionale nella testa della miosina che fa scorrere i filamenti di miosina su quelli di actina. In questo processo viene rilasciato l’ADP