Famiglie di fattori di trascrizione

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Bioinformatica Corso di Laurea specialistica in Informatica RNA: trascrizione e maturazione 21/03/2011.

TRASCRIZIONE del DNA.

STUDIO ESPRESSIONE GENICA.

Il "Dogma centrale" Replicazione DNA Trascrizione Trascrizione

Copolimero Assegnazione dei codoni mediante uso di copolimeri ripetuti contenenti due o tre nucleotidi Codoni presenti Amminoacidi incorporati Codoni.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori.

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI Trans-acting factors = fattori che agiscono in trans Transattivatori = attivatori che agiscono in trans Possono.

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ESERCITAZIONE BIOINFORMATICA

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Famiglie di fattori di trascrizione Dita di zinco Omeodominio (elica-giro-elica) HTH Elica-ansa-elica HLH Cerniera di leucina

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Un terminatore intrinseco è costituito da due regioni palindromiche che formano una forcina di 7-20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente) G T C A U 5 ' 3 - H . C G A U - O H ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC GTTTT CAAAA AAAAAA TTTTTT A T G C U UUUUUU 5' 3' -OH ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 5' 3' G C UUUUUUUU -OH ... CCCA A U

Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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Antiterminazione

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Attenuazione

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Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

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