RCC Biobank for Translational Cancer Research Elena Verzoni

Presentazione sul tema: "RCC Biobank for Translational Cancer Research Elena Verzoni"— Transcript della presentazione:

1 RCC Biobank for Translational Cancer Research Elena Verzoni
SS Oncologia Genitourinaria Fondazione IRCCS Istituto Nazionale Tumori Milano

2 The XXI century challenges toward Precision Medicine

3 What are Biobanks Organized collection of human biological material (and data) stored for research purposes Types of collections clinical - pathology archive, surplus surgical diagnostic – surplus blood, urine, biopsy Patient or population based Population - large scale prospective studies – Patient/clinical – focus on specific disease/cancer Annotation/Data e.g. Sample history, patient information, clinical data, pathology For future use - not project specific - Research Tissue Banks Appropriate governance mechanisms (AIOM-SIAPEC-IAP)

4 Prospective collections
Collection of fresh surgical surplus material to meet specific research need Collection protocols can be standardised (where possible) in all sites Material used in experiments such as in vitro pharmacology, functionality testing, cell culture and nucleic acid extraction Seek consent Surgery performed Tissue Examined and trimmed Any surplus removed Frozen Fresh Fixed

5 Diagnosis (FFPE and frozen) Research (fresh frozen)
Biobanks: the sample path from the start Patient candidates with signed informed consent 20 ml of blood Whole blood Plasma Serum Buffy coats Pre-operative blood removal surgery Samples for Diagnosis (FFPE and frozen) Pathology department Biobank-cryopreservation leftover Samples for Research (fresh frozen)

6 AIMS Application of multiple platforms to the analysis of fresh tissue/blood samples from the same patient Integration of biological and clinical data Access to biological resources of guaranteed quality Support research consortia at national and international levels

7 Biobanca dei Tessuti criocongelati: flusso operativo
blocco operatorio reparto tempo attesa trasporto materiale prelievo chirurgico consenso informato per l’utilizzo del materiale biologico al fine di ricerca La scheda di consenso va firmata dal paziente ed inserita nella cartella clinica Una copia del consenso firmato andrà consegnata, il giorno prima dell’intervento chirurgico, al personale dedicato alla banca tessuti Anatomia Patologica tempo attesa Materiale residuo dopo i prelievi per la diagnosi Banca Tessuti conservazione campioni diagnostici Anatomia Patologica tempo attesa = dall’asportazione al congelamento minuti (per ridurre al minimo l’influenza dei processi di ischemia sulla degradazione delle macromolecole)

8 LIQUID BIOBANK Conservare a -80°C
Per ogni paziente 20 ml sangue intero* 10 ml sangue intero in EDTA 4 ml sangue intero in EPARINA 3.5 ml sangue intero LIQUID BIOBANK 2.5 ml sangue intero 2 aliquote x 1 ml SANGUE INTERO 8 aliquote x 0.5 ml PLASMA EDTA 4 aliquote x 0.5 ml PLASMA EPARINA 3 aliquote x 0.5 ml SIERO 1 aliquota BUFFY COAT EDTA 1 aliquota BUFFY COAT EPARINA PAXGENE per RNA Conservare a -80°C * per studi multicentrici su biopsie liquide è opportuno raccogliere il sangue in blood collection tubes (STRECK tubes), per stabilizzare le cellule nucleate presenti nel sangue

9 Costo per singolo paziente (euro)
Costs La stima dei costi non prevede: ammortamento degli strumenti utilizzati  piccoli strumenti da laboratorio (pipettatori, micropipette, ecc.) e centrifughe materiale “disposable”(guanti, bustine di plastica, ecc.) PERSONALE I costi:  non prevedono IVA  sono calcolati in base ai prezzi di listino  possono variare a seconda dell’offerta fatta all’Ente e/o a promozioni in corso quantità Costo unitario Costo per singolo paziente (euro) Provette vacutainer con EDTA 1 0.26 Provette vacutainer eparina di Litio 0.25 Provette vacutainer con coagulante 0.20 Paxgene per RNA 12.00 Nalgene cryogenic vials 19 0.35 6.65 puntali 7 0.065 0.46 etichette 20 0.10 2.00 Scatole cryoboxes per Nalgene da 2 ml 1 cryobox 81 pozzetti = 4 soggetti 1 cryobox 16 Paxgene= 16 soggetti 1/4 1/16 9.40 2.35 0.59 1 colonna verticale cryorack da 9 scatole=circa 40 soggetti 1/40 145 3.6 28.06

10 Conclusioni Biobanca -> piattaforma di lavoro condivisa adattabile alle necessità Tessuto (Formalina/congelato), Liquida (sangue e derivati) Mandatori ad oggi i dati «biologici» oltre che clinici Competitività a livello internazionale Progetti originali (prospettici/retrospettivi) Partecipazione a bandi/grants

11 We look forward to many joint projects together! Thank you