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PubblicatoAnnalisa Amato Modificato 5 anni fa
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Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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RETROELEMENTI Retrovirus Retrovirus endogeni (ERV)
Retrotrasposoni (Ty1, Ty3, gypsy, copia, LINE, SINE)
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LINE (long interspersed nuclear element)
Contengono trascrittasi inversa Derivano da trascritti pol II Es. LINE-1 (L1) 6,1 Kb 3500 copie intere e centinaia di migliaia tronche
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SINE (short interspersed nuclear element)
Non contengono trascrittasi inversa Derivano da trascritti di pol III Es. Alu Un milione di copie
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Quanti geni sono espressi?
10-20 mila geni sono espressi in ciascuna cellula 90% in comune tra i vari tessuti
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Quanto sono espressi i geni?
Un centinaio di mRNA sono abbondanti: copie/cellula (50% dell’mRNA totale) Il resto (10 000) sono mRNA scarsi: meno di 10 copie/cellula
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Più della metà dei geni di lievito non sono indispensabili
Geni ridondanti (famiglie geniche) Funzioni accessorie
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Le famiglie geniche contengono più geni di quanto prevedibile dall’analisi delle proteine
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Pseudogeni = geni non funzionali
Con introni (duplicati) Maturati (processati)
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Origine degli pseudogeni
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Famiglia dei geni della globina nell’uomo e altri primati
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Siti di sostituzione e siti silenti
.Val.Cys.Arg.Ala.Pro. .Val.Cys.Leu.Ala.Pro. .GTG.TGT.CGA.GCT.CCA. .GTG.TGT.CTA.GCT.CCA. .GTG.TGT.CTT.GCT.CCA.
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Divergenza di due geni (rpL4) separati da 30 milioni di anni
(solo regione codificante)
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Organizzazione delle unità di ripetizione
dei geni per gli istoni in diverse specie
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Tutti i genomi contengono copie multiple
dei geni per l’rRNA e per i tRNA
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I PRECURSORI DEGLI rRNA SONO PIU' LUNGHI
DELLA SOMMA DEI DUE rRNA MATURI
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I PRECURSORI DEGLI rRNA SONO PIU' LUNGHI
DELLA SOMMA DEI DUE rRNA MATURI
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I geni per gli rRNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici
ETS 18S ITS 28S NTS RNA RNA DNA DNA gene promoter 60/81 bp repeats spacer other repetitive elements DNA
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