Patologie associate ad espansione di triplette

Presentazione sul tema: "Patologie associate ad espansione di triplette"— Transcript della presentazione:

1 Patologie associate ad espansione di triplette

2 DNA ripetitivo disperso nel genoma
Classe I: retroelementi (retrovirus, retrotrasposoni) Classe II: trasposoni a DNA

3 Elementi ripetuti nei genomi
Fig ed. 6 Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

4 Meccanismo di trasposizione
Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

5 Meccanismo di trasposizione

6 Trasposoni a DNA Pochi nei mammiferi (3% del genoma nell’uomo)
Elementi Ac/Ds di mais Trasferimento orizzontale di geni Barbara McClintok 1940 – Nobel 1983

7 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

8 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

9 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

10 RETROELEMENTI Retrovirus Retrovirus endogeni (ERV)
Retrotrasposoni (Ty1, Ty3, gypsy, copia, LINE, SINE)

11 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

12 Struttura dei retroelementi

13 LINE (long interspersed nuclear element)
Contengono trascrittasi inversa Derivano da trascritti pol II Es. LINE-1 (L1) 6,1 Kb 3500 copie intere e centinaia di migliaia tronche

14 SINE (short interspersed nuclear element)
Non contengono trascrittasi inversa Derivano da trascritti di pol III Es. Alu Un milione di copie

15 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

16 Quanti geni sono espressi?
10-15 mila geni sono espressi in ciascuna cellula 90% in comune tra i vari tessuti

17 Quanto sono espressi i geni?
Un centinaio di mRNA sono abbondanti: copie/cellula (50% dell’mRNA totale) Il resto (10 000) sono mRNA scarsi: meno di 10 copie/cellula

18 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

19 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

20 Più della metà dei geni di lievito non sono indispensabili
Geni ridondanti (famiglie geniche) Funzioni accessorie

21 Le famiglie geniche contengono più geni di quanto prevedibile dall’analisi delle proteine

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23 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

24 Pseudogeni = geni non funzionali
Con introni (duplicati) Maturati (processati)

25 Origine degli pseudogeni

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27 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

28 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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30 Famiglia dei geni della globina nell’uomo e altri primati

31 Siti di sostituzione e siti silenti
.Val.Cys.Arg.Ala.Pro. .Val.Cys.Leu.Ala.Pro. .GTG.TGT.CGA.GCT.CCA. .GTG.TGT.CTA.GCT.CCA. .GTG.TGT.CTT.GCT.CCA.

32 Divergenza di due geni (rpL4) separati da 30 milioni di anni
(solo regione codificante)

33 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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36 Organizzazione delle unità di ripetizione
dei geni per gli istoni in diverse specie

37 Tutti i genomi contengono copie multiple
dei geni per l’rRNA e per i tRNA

38 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

39 I PRECURSORI DEGLI rRNA SONO PIU' LUNGHI
DELLA SOMMA DEI DUE rRNA MATURI

40 I precursori degli rRNA subiscono maturazione

41 I geni per gli rRNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici
ETS 18S ITS 28S NTS RNA RNA DNA DNA gene promoter 60/81 bp repeats spacer other repetitive elements DNA