IL PROGETTO GENOMA UMANO (HGP)

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1 IL PROGETTO GENOMA UMANO (HGP)
2 metri di DNA; 46 cromosomi; 3 MILIARDI di coppie di basi (A, T, C, G); GENI 1

2 GENI E GENOMI 2001 N° geni Homo s. (bp) 30000 (2.6x109)
4000 (4.6x106) 6000 (1.2x107) 13600 (1.2x108) 30000 (2.6x109) N° geni (bp) Drosophyla m. Saccharomyces c. Escherichia c. Homo s. 1997 1996 2000 2001

3 IL PROGETTO PROTEOMA UMANO (HPP)… …I GENI ERANO SEMPLICI
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4 Cosa si intende per PROTEOMA?
Identifica TUTTE le PROTEINE espresse da un GENOMA in una cellula, un tessuto od organismo Definisce come queste proteine si organizzano in RETI di INTERAZIONE Descrive la STRUTTURA TRIDIMENSIONALE di queste proteine con lo scopo di poter identificare un FARMACO in grado di attivarne o disattivarne la funzione

5 La Proteomica nell’era post-genomica

6 La Proteomica nell’ era post-genomica
Identificazione delle proteine Studio delle modificazioni post-traduzionali Esame delle reti di interazioni proteina-proteina Confronto differenziale tramite analisi bidimensionale Determinazione della funzione Medicina Molecolare

7 ANALISI BIDIMENSIONALE

8 Identificazione di proteine cellulari

9 C - Cellule Cristallino
Identificazione degli spots ... C - Cellule Cristallino Control 500mM H2O2 (10 min) ... e dopo alcuni tentativi di levarci via il DNA. Vedremo. Grazie, mandi, ciao ciao. 7 cm, 3-10 pH, Ag Maldi - C

10 Profilo di espressione proteica (H2O2 vs ctrl)

11 IDENTIFICAZIONE DI PROTEINE SOGGETTE AL TRATTAMENTO
Stress Ossidativo come modello cellulare per lo studio della cataratta: IDENTIFICAZIONE DI PROTEINE SOGGETTE AL TRATTAMENTO Controllo 500mM H2O2 (10 min) PrxI PrxI 3 10 pH 3 10 pH

12 LA FUNZIONE DELLE PROTEINE NELL’ERA POSTGENOMICA
CLASSICA POST GENOMICA

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14 Identification of tumor markers from the study of Thyroid differentiation program
TUMORAL TISSUES (Thyroid and other) Tumoral marker) THYROID CELL LINES: Normal vs transformed (different degree of differentiation PROTEIN of INTEREST MALDI-MS Identification (CNR Naples) 2-D GEL ANALYSIS Cell Mapping Proteomics NUCLEAR PROTEINS DNA-binding proteins, Co-activators, repressors, Transcriptional regulators Expression Proteomics MOLECULAR MODEL (‘in vitro’ and ‘in vivo’ assays) Intermolecular Networks (GST-Pulldown, IP) Differential global pattern analysis