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Esercitazione 1 www.uniprot.org.

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Presentazione sul tema: "Esercitazione 1 www.uniprot.org."— Transcript della presentazione:

1 Esercitazione 1

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18 Esempio Quante sono le proteine di uomo più lunghe di aminoacidi?

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25 Esempio Quante sono le proteine di uomo e topo depositate in swissprot dallinizio di questanno ?

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31 Esempio E quelle solo di topo?

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34 Esempio Di queste quante sono quelle la cui esistenza è realmente provata?

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37 Esempio Quante sono le proteine di membrana?

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39 Esempio Scaricare una lista di proteine

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44 Lista.txt

45 Campi ricercabili Data di Creazione Lunghezza della Sequenza EC number Specie ( Human; Yeast; Coli; 5000 Rat; 3000 Drosophila) Classificazione ( bacteria; Eukaryota; Vertebrata; Primates) Commenti -> Subcellular Location (Nulceus,cytoplasm, mitochondrion, membrane) Tissue (Liver, Skeleton, Heart Skin, Blood) Catalytic activity Cofactor (zinc, iron, heme, calcium) Post Transcriptional Modification Subunit (monomer,heterodimer, homodimer, homotetramer) Disease Features -> Active sites, Metal, Transmembrane, Signal Mod_res, DNA bind, Disulfid, Carbohyd Per rifinire-> Nome proteina, Nome gene, Identificativo

46 20 Questions E un Europeo? SI E un politico? SI E un contemporaneo? NO E morto di vecchiaia? NO E di un vertebrato? NO E un enzima? SI E una proteina di membrana? NO E più lunga di 100 aminoacidi? SI about a protein

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