SPLICING eliminazione introni unione esoni esone1 introne1 esone2 GT AG GT AG SPLICING eliminazione introni introne1 introne2 esone2 esone3 esone1 unione esoni esone1 esone2 esone3
Alcuni modo di fare alternative splicing
Riconoscimento degli introni Motivi conservati
Meccanismo dello splicing
Particelle dello splicing - SnRNPs (Small nuclear ribonuclear proteins) binds critical sites on the pre-mRNA - pronounced ‘SNURPs’ - these are complexes containing both protein and small RNAs the small RNAs are transcribed by RNA polymerase III they then associate with accessory proteins the complex then recognizes critical sites for splicing by base pairing
Particelle che intervengono nello splicing
U1 snRNP
Intron definition exon definition
Modello di exonic splicing enhancer mediato da proteine SR
Modello di exonic splicing silencer
Modelli di splicing silencing Nell’esone si trovano motivi ESE e ESS sovrapposti, quindi c’è una competizione diretta tra i fattori che stimolano lo splicing (SR) e quelli che lo inibiscono (hnRNP). Il legame di uno o dell’altro elemento è mutuamente esclusivo. A questo punto i fattori importanti diventano la maggiore affinità di legame degli elementi regolativi e la concentrazione di questi.
Modelli di splicing silencing Fattore inibitori per lo splicing si legano a elementi Intronic Splicing Silencer e per dimerizzazione formano un anello che esclude l’esone
Modelli di splicing silencing Se non ci sono elementi inibitori l’esone viene incluso, se ci sono elementi inibitori e se questi si legano per primi, promuovono il legame di altri elementi inibitori (polimerizzazione) od ostacolano il legame di elementi rafforzativi
Nonsense mediated decay
Why Splicing? 1. The intron-exon arrangement may facilitate the evolution of new proteins through recombination of exons.
2. Splicing increases the coding potential of the genome through alternative splicing. 60% of transcripts in human are spliced in different ways. Cell-type spcific splicing of fibronectin pre-mRNA