Davide Salomoni INFN-CNAF Workshop DUCK Bologna, 10 novembre 2010 Sommario delle presentazioni
2 10/11/2010 D.Salomoni, Summary Workshop DUCK DUCK: l’accordo di collaborazione (Distributed Unified Computing for Knowledge) Accordo di Collaborazione fra comunità scientifiche multidisciplinari per problematiche e infrastrutture di calcolo distribuito in Emilia Romagna. Attività di ricerca e sviluppo su servizi e infrastrutture di Grid e Cloud Computing nella regione E.R. Espansione di servizi e infrastrutture verso componenti pubbliche e private della Regione Partecipazione coordinata a bandi regionali, MIUR ed europei Formazione, trasferimento tecnologico
09:30 ->11:00 Servizi di calcolo distribuito per l'infrastruttura Comput-ER Grid, Cloud e Tecniche di Virtualizzazione,Gestione dei dati e GPU in Grid per HPC Davide Salomoni,Francesco Giacomini (INFN - CNAF) Comput-ER, l'infrastruttura di calcolo distribuito in Emilia Romagna Marco Bencivenni (INFN-CNAF), Paolo Veronesi (INFN-CNAF) 11:30 ->15::00 Applicazioni Scientifiche in Grid 11:30 Bioinformatica e Medicina Molecolare, Rita Casadio, Guido Biasco, Silvio Bicciato 12:15 Oceanografia Operativa e il calcolo distribuito, Nadia Pinardi 12:30Scienze Marine: Modellazione 3-D di flussi del mantello litosferico in Dorsali oceaniche, Giovanni Bortoluzzi,Marco Ligi 12:45 Applicazioni di chimica computazionale su GPU: studi su nanosistemi ibridi (biologici, organici e inorganici) e proteine, Stefano Ottani, Alessandro Venturini 13:00 Pausa pranzo 14:00 Modelli di calcolo distribuito in HEP, Vincenzo Vagnoni, Eleonora Luppi 14:15 Calcolo distribuito in Radioastronomia, Mauro Nanni 14:30 Gestione di dati satellitari e simulati di evoluzione stellare, Giuliano Taffoni 14:45 Gestione avanzata di dati in grid per i cambiamenti climatici, Giovanni Aloisio Agenda con presentazioni sull’attività svolta finora
4 10/11/2010 D.Salomoni, Summary Workshop DUCK Il workshop di oggi Tecnologie software a disposizione per il calcolo distribuito Consolidate (Grid Computing) e in evoluzione (Cloud Computing, uso di GPU) La configurazione di partenza (“best-effort”) di comput-er Applicazioni distribuite sulla infrastruttura comput-er 4
5 10/11/2010 D.Salomoni, Summary Workshop DUCK Tecnologie ed usi - I Calcolo distribuito: astrazione dalle dipendenze fisiche attraverso tecniche di virtualizzazione su commodity hardware Grid computing, in uso in ambito scientifico da circa 10 anni Cloud computing, ottime prospettive ma con diversi punti (tecnici, di policy) da esplorare e fare evolvere attentamente Semplificazione dell’accesso e dell’utilizzo delle risorse Federazioni di Cloud (pubbliche, private) Evoluzione delle sottomissioni di job tradizionali Utilizzo di istanze di calcolo logiche anziché fisiche Attraverso l’uso di GPU (richiesto ripensamento del trattamento dati/algoritmi) Ricerca dei dati attraverso la loro identificazione logica Data mining, data identification / replication, metadata definition
6 10/11/2010 D.Salomoni, Summary Workshop DUCK Tecnologie ed usi - II Indipendenza dalla localizzazione fisica dell’hardware Ownership? Trust? Ottimizzazione dell’uso delle risorse Condivisione, facilità d’uso (portali) Supporto di use case non facilmente gestibili con modelli di calcolo tradizionali o basati su infrastrutture non distribuite Possibilità di creare una grid (o “cloud”) elastica per la fornitura di servizi / risorse on-demand
7 10/11/2010 D.Salomoni, Summary Workshop DUCK L’infrastruttura comput-er Significativa esperienza all’interno delle comunità partecipanti al progetto In particolare: Sviluppo di algoritmi ed applicativi ad alte prestazioni Grid computing Contributi e sinergia di infrastrutture piccole, medie e grandi Utilizzo, ricerca e test su tecnologie innovative (Cloud computing, GPU)
8 10/11/2010 D.Salomoni, Summary Workshop DUCK Applicazioni su comput-er Vantaggi comuni: condivisione / utilizzo di risorse distribuite condivisione di expertise sperimentazione di nuove tecnologie / servizi Bioinformatica / Medicina MolecolareTempi di analisi strumentale comparabili con i tempi computazionali; rapida diagnosi e terapia; nuove scale possibili per annotazione genomica Oceanografia operativaValutazione dell’incertezza delle previsioni attraverso metodi Montecarlo distribuiti Modellazione 3-D nelle Scienze della TerraRiduzione dei tempi di simulazione da mesi a giorni attraverso uso opportunistico delle risorse Chimica computazionaleApplicazioni delle GPU alla dinamica molecolare Fisica delle alte energieUso massiccio di grid computing per ricostruzione ed analisi di eventi; esplorazione d’uso di Cloud computing, evoluzione di computing models RadioastronomiaAggregazione di data set distribuiti. Uso dinamico delle risorse come strumento sostenibile per la definizione di nuovi esperimenti Evoluzioni? sostenibilità dell’infrastruttura potenzialità di rapporto tra ricerca scientifica, enti pubblici e iniziative private formazione / disseminazione
9 Tavola Rotonda Il workshop costituisce un'importante occasione di scambio con altri enti e settori di ricerca, esponenti della Regione utile a valutare la possibilità di ulteriori sinergie, impatto sul territorio e prospettive future. "Infrastrutture per il calcolo Scientifico in Emilia Romagna: benefici, impatto sul territorio e prospettive future". Moderatore Antonio Zoccoli Interverranno sull'aspetto "Benefici“ Mariangela Ravaioli, presidente dell'Area di Ricerca di Bologna CNR/INAF, sui benefici dell'iniziativa per il CNR/INAF (5-10min) Rita Casadio, coordinatrice del Biocomp Group, interverra' sul tema "Benefici di una infrastruttura per il calcolo distribuito per l'analisi dei dati nell ' era postgenomica a fini bio- medici" (5') Antonio Navarra, direttore del CMCC, ci parlera' dei benefici dell'iniziativa duck per il CMCC/INGV (5') Mirco Mazzucato, coordinatore della Grid Italiana (IGI), interviene su "Prospettive dell'infrastruttura di calcolo distribuita: IGI ed EGI" (10') Dario Braga, prorettore alla ricerca, sui benefici di una infrastruttura distribuita nell'ambito universitario e del tecnopolo di UNIBO (5').
10 Interverranno sull'aspetto "Impatto sul territorio e prospettive future": Paolo Bonaretti, direttore di Aster, (delegato dellìassessore alla ricerca Patrizio Bianchi) ci parlera' delle iniziative della regione ER sul trasferimento tecnologico, Roberto Zamboni, CNR, responsabile tecnopolo CNR-AMBIMAT, fara' una illustrazione del tecnopolo CNR AMBIMAT, come esempio di trasferimento tecnologico, Lucia Mazzoni, dell'Aster, referente per la tematica ICT nell'ambito dei tecnopoli, farà il punto sui lavori della piattaforma ICTeDESIGN, Sanzio Bassini, Direttore del Dipartimento Super Calcolo del CINECA, con un intervento su: Il cineca e l'iniziativa duck, prospettive di collaborazione Gianluca Mazzini, direttore generale di Lepida, ci parlera' di Lepida Silvano Bertini, responsabile servizio politiche di sviluppo economico, sui programmi della Regione di interesse per l'iniziativa duck. Tavola Rotonda