Gli Enzimi La maggior parte degli enzimi sono proteine Le proteine sono particolarmente efficienti nel legare una grande varietà di molecol e Gli enzimi riducono l’energia di attivazione delle reazioni Modificano le velocità delle reazioni non gli equilibri Gli enzimi sono caratterizzati da : Potere Catalitico; Velocità = 10 3 – 10 6 Specificità; Rendimento = 100%
Nomenclatura A poenzima ; parte proteica di un enzima Oloenzima; Enzima cataliticamente attivo Cofattori; ioni inorganici Coenzimi; molecole organiche Gruppi Prostetici; legati covalentemente all’enzima
Parti Fondamentali di un Enzima Sito Attivo Sito di Legame Sito catalitico
G°’: Variazione di energia libera standard biochimica
G°’= -RT lnK’ eq K’ eq = [P] [S] V = k [S]
Modello Chiave - Serratura L’energia di legame e’ la fonte di energia libera utilizzata per abbassare l’energia di attivazione
Modello Adattamento Indotto L’energia di legame e’ massima allo stato di transizione
Il Sito Attivo Occupa una parte piccola della molecola enzimatica Lega il substrato mediante interazioni deboli ma specifiche che si sostituiscono a quelle con l’acqua Complesso Enzima-Substrato Effetto Prossimità-Orientamento
Specifici gruppi contribuiscono alla catalisi.
Relazione tra velocità iniziale e concentrazione del substrato
Lezione 10
K m = ½ V max Cinetica di Michaelis & Menten: Velocità iniziale della reazione allo stato stazionario K 1 K 3 E + S ↔ ES → E + P K 2 K m = K 1 + K 2 _ K 3
Efficienza della reazione = Tappa limitante
Linearizzazione: Grafico dei doppi reciproci
Paragone dell’attività di un enzima per diversi substrati.
L’attività enzimatica dipende dal pH
INIBIZIONE REVERSIBILE
Nell’inibizione competitiva aumenta la Km apparente
Nell’inibizione non-competitiva diminuisce la Vmax
Glucochinasi forma isozimatica nel fegato Gli isozimi catalizzano la stessa reazione con caratteristiche cinetiche differenti
Effetto di modulatori su un enzima allosterico
Modulazione Positiva o Negativa di un Enzima Allosterico Esempio Glicogeno Fosforilasi
Curva sigmoide di un enzima allosterico omotropico
Enzima Regolato per Modificazione Covalente
Sintesi di Zimogeni
Meccanismi di regolazione dell’attività enzimatica Enzimi Regolatori Modificazioni Covalenti Attivazione proteolitica di Zimogeni Retroinibizione
Modificazioni covalenti post-traduzionali di proteine ed enzimi