Analisi di Immagini e Dati Biologici

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Analisi di Immagini e Dati Biologici Edge detection and sharpening L4-2017

Bordi In un'immagine grayscale gli oggetti sono distinguibili dallo sfondo o da altri oggetti perché hanno un intensità luminosa differente La linea di confine tra le due regioni di diversa intensità luminosa determina un bordo

Bordi Quando è determinabile il bordo di un oggetto o di una regione è determinato da due grandezze La direzione lungo la quale avviene la transizione di luminosità La grandezza della variazione luminosa nei punti che appartengono alla regione del bordo (la forza del bordo)

Bordi

Determinazione dei Bordi Distribuzione delle variazioni di luminosità Variazioni localmente rilevanti (corrispondono a veri bordi) Stima della direzione della massima variazione di luminosità Limitazione dell’interferenza del rumore o dei pattern di variazione incoerenti

Bordi

Bordi >> img(145:155,275:285) ans = 11×11 uint8 matrix 77 68 74 59 89 62 81 66 56 76 70 68 56 64 60 64 59 92 89 61 72 69 73 55 59 53 74 76 89 66 60 47 93 65 70 81 63 69 54 80 61 73 62 108 58 63 70 78 95 75 95 87 93 73 82 83 74 75 76 86 92 100 99 104 102 126 138 149 159 177 189 208 215 229 238 244 249 253 254 254 255 255 254 254 253 254 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255

Bordi e Derivate Lo studio della variazione locale di una funzione porta al concetto di derivata La distribuzione dell'intensità di un immagine è discretizzata dalla matrice di pixel Approssimiamo la derivata con una differenza centrata nel punto

Bordi e Derivate

Variazioni di luminosità

Gradiente di luminosità Vettore di variazione dell'intensità lungo una direzione qualsiasi Le 2 componenti del vettore sono le proiezioni lungo gli assi del vettore di massima variazione di intensità luminosa

Gradiente di Luminosità Rappresenta un vettore che indica la direzione di massimo cambimento di intensità luminosa Rapidità di variazione unitaria

Blob luminoso Il bordo è all’interno di una regione di transizione Definiamo il bordo sulla base della massima pendenza

Funzione 2D dell'immagine

Derivata lungo l'asse orizzontale

Derivata lungo l'asse verticale

Immagini delle Derivate Per rappresentare come immagini le superfici delle derivate usiamo la funzione mat2gray Ricalcola la superficie in modo che I suoi valori siano tra 0 e 1

Immagini delle Derivate

Gradiente di luminosità La forza di un bordo è data dalla magnitudine del vettore gradiente

Modulo del gradiente

Determinazione del bordo Bordo stimato: insieme dei punti di massima pendenza Massima pendenza: punti di massimo valore del modulo del vettore gradiente

Gradiente di luminosità L'orientamento è l'angolo (misurato rispetto all'asse orizzontale) della direzione di massima intensità

Gradiente di Luminosità

Vettori gradiente

Filtri di Derivazione

Filtro di Derivata

Matrici di Gradiente Matrici di Prewitt Stimano la derivata lungo un asse eseguendo allo stesso tempo una media sull'asse ortogonale per ridurre l'influenza del rumore La funzione fspecial di Octave può generare la matrice di Prewitt orizzontale

Matrici di Gradiente Matrici di Sobel Funzionano come quelle di Prewitt, ma usano una media pesata sulla dimensione ortogonale La funzione fspecial di Octave può generare la matrice di Sobel orizzontale

Matrice di Prewitt Derivata lungo l'asse y Derivata lungo l'asse x 1 1 1 0 0 0 -1 -1 -1 Derivata lungo l'asse x 1 0 -1

Matrici di Roberts Un caso semplice sono le matrici di Roberts massimizzano le variazioni di luminosità che avvengono lungo le direzioni diagonali

Modulo del gradiente

Esempio con Octave/Matlab imshow(imgr) figure bordo = imgr > 0.95; imshow(bordo.*ones(size(imgr)))

Funzione edge di Octave La funzione edge ritorna un'immagine binaria dei bordi individuati con vari metodi Ammette parametri di controllo Nel caso di Sobel e Prewitt il parametro opzionale indica la soglia da applicare al modulo della derivata octave:2> borders=edge(disco,"prewitt"); octave:3> imshow(borders) octave:4> [borders,threshold]=edge(disco,”prewitt”); octave:5> borders=edge(disco,”prewitt”,1.1*threshold); octave:6> imshow(borders)

Funzione edge di Octave

Confronto di Metodi (Octave) Sobel Prewitt

Confronto di metodi (octave) Roberts Canny

Matrici di Gradiente

Compass Operators Matrici che massimizzano il modulo del gradiente all'interno di un quadrante Le 8 matrici del metodo sono state ideate in modo generare un vettore gradiente con modulo che diventa massimo quando la variazione di intensità in un punto avviene in uno di otto quadranti in cui l'angolo giro è suddiviso Di 8 matrici devono essere calcolati solo 4 gradienti (essendo il modulo degli altri quadranti uguale, ma cambiando il verso del vettore gradiente)

Compass Operator

Operatori basati sulla derivata seconda

Laplacian of Gaussian (GoL) Modello bordo con andamento 'smooth' può essere assimilato ad una funzione sigmoidale Si assume che il bordo sia dove la funzione pendenza cambia di concavità. Si cerca quindi i punti dove la derivata seconda cambia di segno (quindi dove in qualche punto attraversa lo zero)

Laplacian of Gaussian (GoL)

Laplacian of Gaussian (GoL) Immagine di cellule osservate con microscopia ottica

Laplacian of Gaussian (GoL) LoG 5x5,9x9 Dispersione 1.5

Laplacian of Gaussian (GoL) Implementato nella funzione edge Ammette 2 parametri di controllo: soglia e dispersione della gaussiana

Metodo di Canny Metodo analitico basato sull'ipotesi di modello gaussiano del rumore Minimizza l'errore di localizzazione del bordo Minimizza i falsi positivi Minima ridondanza della localizzazione Implementato da edge

Metodo di Canny Octave offre un'implementazione del Metodo di Canny

Metodo di Canny

Edge Sharpening

Edge Sharpening Il riconoscimento dei contorni permette di costruire immagini binarie di regioni di un immagine L'organizzazione dei contorni favorisce la percezione delle strutture La forza di un bordo è il fattore determinante per suo riconoscimento L'edge sharpening mira al miglioramento della forza dei bordi e dei contorni

Edge Sharpening Strategia: aumentare le differenze di intensità dove ci sono bordi All'immagine da migliorare viene sottratta una quota (controllata da un parametro)

Edge Sharpening

Edge Sharpening Operatore di Laplace

Edge Sharpening Operatore di Laplace in forma discreta

Edge Sharpening

Operatore di Laplace Applicazione dell'operatore di Laplace per esaltazione dei bordi ('*' è l'operatore di convoluzione implementato dalla funzione imfilter di Octave

Unsharp Masking L'unsharp masking viene costruito in 2 fasi Si crea una immagine smoothed che viene sottratta all'immagine originale. Questo costituisci la 'maschera' (mask) La maschera viene di nuovo aggiunta all'originale usando un parametro di controllo

Unsharp Masking

Unsharp Masking Maschera ottenuta sottraendo l’immagine filtrata con un filtro gaussiano di dimensione 31 e dispersione 6