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Sequenza di Shine-Dalgarno

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Traduzione degli mRNA policistronici nei procarioti 5' 5'

Inizio della traduzione negli eucarioti

Initiation Factors prokaryotes eukaryotes Activity prokaryotes eukaryotes IF3 eIF-1 Fidelity of AUG codon recognition IF1 eIF-1A Facilitate Met-tRNAiMet binding to small subunit eIF-2 Ternary complex formation eIF-2B (GEF) GTP/GDP exchange during eIF-2 recycling eIF-3 (12 subunits) Ribosome antiassociation, binding to 40S eIF-4F (4E, 4A, 4G) mRNA binding to 40S, RNA helicase activity eIF-4A ATPase-dependent RNA helicase eIF-4E 5' cap recognition eIF-4G Scaffold for of eIF-4E and -4A eIF-4B Stimulates helicase, binds with eIF-4F eIF-4H Similar to eIF4B eIF-5 Release of eIF-2 and eIF-3, GTPase IF2 eIF5B Subunit joining eIF-6 Ribosome subunit antiassociation

La sequenza consenso di Kozak Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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eIF-2 forma un complesso ternario con Met-tRNAf Negli Eucarioti eIF-2 forma un complesso ternario con Met-tRNAf Il complesso ternario lega la subunità 40S libera che si lega all’estremità 5’ dell’mRNA GTP viene idrolizzato quando eIF2 viene rilasciato come eIF2-GDP eIF-2B rigenera la forma attiva. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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40 S 40 S 60 S 40 S 4G AUG 4E 4G 3 4A AUG 4E 4B 4A AUG 5 Cap Cap Cap

Inizio di traduzione nell’mRNA di poliovirus AUG AUG AUG AUG UUUCCUUUU A U G IRES= Internal ribosome entry site

Traduzione: l’allungamento

Fattori di allungamento procarioti eucarioti EF-Tu eEF1A trasporto aa-tRNA EF-Ts eEF1B riciclo EF-G eEF2 traslocazione

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Traduzione: terminazione

Fattori di terminazione procarioti eucarioti RF1 eRF1 riconoscimento UAA, UAG RF2 “ riconoscimento UGA, UAA RF3 eRF3 GTPase RRF rilascio

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Inhibitor Effect Chloramphenicol inhibits prokaryotic peptidyl transferase Streptomycin inhibits prokaryotic initiation, also induces mRNA misreading (Neomycin) Tetracycline inhibits prok. aminoacyl-tRNA binding to the ribosome small subunit Erythromycin inhibits prokaryotic translocation through the ribosome large subunit Fusidic acid similar to erythromycin only by preventing EF-G from dissociating from the large subunit Puromycin resembles aa-tRNA, interferes with peptide transfer resulting in premature termination in prok and euk Diptheria toxin catalyzes ADP-ribosylation of and inactivation of eEF-2 Ricin found in castor beans, catalyzes cleavage of the euk. 28S rRNA Cycloheximide inhibits eukaryotic peptidyltransferase

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