UNIVERSITÀ DEGLI STUDI “MAGNA GRÆCIA” DI CATANZARO FACOLTÀ DI FARMACIA SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE FARMACIA OSPEDALIERA CATTEDRA DI CHIMICA FARMACEUTICA INIBIZIONE DELL’ATTIVITA’ DELLA TRASCRITTASI INVERSA AD OPERA DELL’OSSIDO NITRICO
STRUTTURA DEL VIRUS DELL’HIV-1
RUOLO DELL’RNA VIRALE
SUBUNITA’ CHE FORMANO L’ETERODIMERO TRASCRITTASI INVERSA Carson, M. (1987) J. Mol. Graphics 5, 103-106.
SUPERFICIE DELL’ENZIMA ACCESSIBILE AL SOLVENTE
RESIDUI AMINOACIDICI DI CONTATTO TRA P66 E P51 In blu: V21, k22, P25, P52, E53, N57, T131, N136, N137, E138, T139. In azzurro: P392, I393, Q394, E396, T397, T400, W401, N418, P420, L422. In rosa: N255, Q258, V261, N265, V276, L283, T296, L289. Pradeep K. Et al., BMC Biochemistry 2002, 3:18
ATTIVITA’ CATALITICHE ED OMOLOGIE NELLA STRUTTURA PRIMARIA
MOTIVO RESPONSABILE DELL’ATTIVITA’ POLIMERASICA: YMDD D. W. Rodgers et al., (1995) Biochemistry 92: 1222-1226.
INETRAZIONI TRA IL POLLICE DI P51 E IL SITO RNasi H DI P66 Julias, J. G. et al., (2001). J. Virol. 75, 6537-6546.
POSSIBILI TARGETS DELLA TERAPIA ANTI-HIV
RESIDUI AMINOACIDICI MUTANTI CHE INDUCONO RESISTENZA AGLI INIBITORI NUCLEOSIDICI E NON-NUCLEOSIDICI.
SITO POLIMERASICO LEGATO A CP-94,707 INIBITORE NON-NUCLEOSIDICO DI RT.
RUOLO DEI MACROFAGI DURANTE L’EVOLUZIONE DELL’INFEZIONE Presentazione dell’antigene Fagocitosi Secrezione di citochine Produzione di radicali reattivi ed ossido nitrico Thomas R. et al., Virology 212:174-178 (1995)
Donatori dell’ossido nitrico usati da Persichini e collaboratori: SIN-1 NOC-18 NOR-3 SNO-102 SNP
MODELLI CRISTALLOGRAFICI USATI IN QUESTO STUDIO: PDP ID: 1RTJ, 2.35 Ǻ PDP ID: 1RTD, 3.20 Ǻ
OSSIDO NITRICO CO2H H2NCH H2C SH Ossidazione Y183 Y188 W229 S-nitrosilazione C38 C280 C62 CO2H H2NCH H2C SH
FATTORI FAVORENTI: Accessibilità del solvente ai gruppi tiolici. Presenza di residui basici che facilitano la deprotonazione del gruppo tiolico aumentandone la reattività (istidina, arginina, lisina). Presenza di residui basici che stabiliscono la forma protonata del gruppo tiolico (acido aspartico, acido glutammico).
CONCLUSIONI OSSIDO NITRICO Patologie cardiovascolari AIDS ?