DISTANZE GENETICHE qK pK qL pL Prendiamo due popolazioni: K e L le analizziamo per un locus biallelico i cui alleli hanno frequenze: qK tale che pK = 1- qK Prendiamo due popolazioni: K e L le analizziamo per un locus biallelico i cui alleli hanno frequenze: qK tale che pK = 1- qK e qL tale che pL = 1- qL Prendiamo due popolazioni: K e L 1 K qK pK qK L qL pL q qL
DISTANZE GENETICHE qL K L qK pK pL Possiamo considerare la distanza genetica tra le popolazioni K e L in funzione dell’angolo . Quindi: L K qL 1 K L qK pK pL Sostituendo i valori:
DISTANZE GENETICHE qL K L qK pK pL Esistono due metodi per misurare la distanza in funzione dell’angolo 1) mediante l’arco di circonferenza tra K e L L K qL 1 K L qK pK pL 2) mediante la corda
DISTANZE GENETICHE I metodo: calcolo della distanza genetica in funzione dell’arco di circonferenza tra i punti K e L Dato che: corrisponde al valore di 1, cioè a una sostituzione completa, possiamo misurare la distanza relativamente alla sostituzione completa:
DISTANZE GENETICHE II metodo: calcolo della distanza genetica in funzione della corda tra i punti K e L Dal teorema di Pitagora: L K qL 1 qK qL q qK pK pL quindi
DISTANZE GENETICHE In questo caso, sempre tenendo presente che due punti alle estremità di un arco di 90° (/2 in rad) rappresentano una sostituzione completa, e quindi la massima distanza possibile che corrisponde al valore di 1, possiamo misurare la distanza relativamente alla sostituzione completa: quindi sostituendo i valori delle frequenze alleliche:
DISTANZE GENETICHE Se analizziamo le due popolazioni K e L per loci multiallelici le cui frequenze alleliche siano: p1, p2, p3, …, pi, …, pn tali che allora e
DISTANZE GENETICHE D d1 d2 Se le due popolazioni vengono analizzate per due loci indipendenti, la distanza che si ottiene per un locus può essere combinata con la distanza ottenuta con l’altro locus mediante il teorema di Pitagora. d1 d2 D da cui
DISTANZE GENETICHE locus 1 d1 locus 2 d2 locus 3 d3 Se i loci che si analizzano sono più di due, locus 1 d1 locus 2 d2 locus 3 d3 • • • • • • • • locus n dn la distanza è