Dati sulla struttura del DNA

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Il superavvolgimento negativo
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Transcript della presentazione:

Dati sulla struttura del DNA Contiene due catene Le percentuali G=C e A=T Legami fosfodiesterici tra nucleotidi

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L’appaiamento delle basi implica la formazione di legami idrogeno H s u g a r citosina guanina N O H s u g a r C 3 timina adenina

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Figura riportata nella pubblicazione originale di Watson e Crick Nature, Aprile 1953

20 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

La struttura del DNA (B) Il DNA ha una forma ad elica regolare, diametro 20Å, passo 34Å Legami idrogeno tra le basi L’impilamento delle basi è determinato da interazioni idrofobiche Ogni coppia è ruotata di 36° Solchi maggiore (22Å) e minore (12Å) Avvolgimento in senso orario (elica destrorsa)

It has not escaped our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a possible copying mechanism for the genetic material.

Il modello a doppia elica di Crick e Watson suggerisce un meccanismo di replicazione

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Strutture alternative del DNA

Gli acidi nucleici possono formare vari tipi di doppia elica

Gli acidi nucleici possono formare vari tipi di doppia elica Coppie di basi per giro Rotazione tra due basi Diametro B 10 (10,4) 36 (34,6) 20 (19) A 11 32,7 23 Z 12 -30 18

Strutture superiori del DNA

DNA superavvolto negativamente DNA circolare con superavvolgimento = 0

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Il superavvolgimento negativo DNA superavvolto negativamente Il superavvolgimento negativo può convertirsi nella separazione locale dei due filamenti

separazione dei filamenti (denaturazione di regioni ricche in A+T) struttura Z (in corrispondenza di regioni di alternanza Pu/Py) strutture cruciformi (in corrispondenza di palindromi)

Superavvolgimento del DNA Positivo = DNA superspiralizzato Negativo = DNA sottospiralizzato

Enzimi che alterano la topologia del DNA Topoisomerasi: tipo I tipo II (girasi)

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Enzimi per gli acidi nucleici Polimerasi: DNA polimerasi RNA polimerasi Nucleasi: esonucleasi endonucleasi

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