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Definizioni: genoma trascrittoma proteoma
Paradosso del valore C Eccesso di DNA rispetto alla complessità Variazioni di valore C per complessità simili
Struttura del genoma eucariotico Sequenze ripetute DNA non codificanti Geni interrotti
Sequenze ripetute nel genoma umano Uniche Maggior parte dei geni (1-10 volte) circa 40% Geni reiterati in tandem (rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.) Mediamente ripetute (da centinaia a migliaia Alcune sequenze regolative di volte) intersperse 40-50% Alcune sequenze a funzione speciale (centromeri, origini, etc.) Altamente ripetute DNA satelliti (da decine di migliaia sequenze semplici a milioni di volte) 5-10%
geni per: rRNA (300) tRNA (1300) 5S RNA (2000) istoni (20) sequenze ripetute intersperse sequenza Alu: 300 nt (x 1.000.000) sequenze semplici o satelliti: 2-10 nt (x 2-100 copie in tandem x 1-100 blocchi interspersi)
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.
La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire con l'aumentare della grandezza del genoma
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Sharp e Roberts 1977 – Nobel 1993
Gene per il collagene 1a2 di pollo
Esoni: sequenze rappresentate nell’RNA maturo Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006