Laboratorio di Biologia Molecolare Alma Mater Studiorum – Università di Bologna DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio di Biologia Molecolare Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria Dario de Biase Tutor Prof.ssa Annalisa Pession Bologna, 09 Giugno 2015

Diagnostica Molecolare Di cosa ci occupiamo? Caratterizzazione molecolare di neoplasie solide DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Da cosa partiamo? Analizziamo il DNA da: - tessuti freschi (resezioni chirurgiche/biopsie) - tessuti FFPE (resezioni chirurgiche/biopsie) - campioni citologici (diretti/strisci su vetrino) Cosa analizziamo? Markers molecolari Diagnostici Prognostici Predittivi

Ca. papillifero-follicolare Principali indagini di diagnostica molecolare DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Tessuto Lesione Markers Indicazione Terapeutica Clinica Polmone NSCLC EGFR KRAS S/R R Erlotinib/ Gefitinib - EML-ALK S Crizotinib Colon Adenocarcinoma metastatico NRAS Cetuximab/ Panitumumab BRAF Prognostico neg. Cervello Neoplasie gliali MGMT IDH1-2 Temozolomide Prognostico pos. Tiroide Ca. papillifero-follicolare BRAF-RAS Radioiodio Diagnostico Ca. midollare RET Vandatenib Cute Melanoma Vemurafenib Dabrafenib Pancreas Lesioni maligne/ Lesioni ano-genitali Condiloma HPV-typing Incremento Rischio Polmone Resezioni da nsclc: adenocarcinomi o squamo con componente adenocarcinomatosa Biopsie: nsclc Alk se doppio negativo Colon: KRAS adeno metastatici ma anche SCLC (basandosi su caratteristiche cliniche, es. fumatore o non) MSI adeno stadio IV alti instabili rispondono peggio al 5FU Brain: neoplasie gliali metilazione MGMT preditivo pos per TMZ IDH1/2 fattore prognostico positivo Tiroide PTC: BRAF mut marcatore diagnostico, “prognostico”, predittivo negativo alla terapia con radio iodio MTC: RET mutato predittivo positivo per vandatenib Melanoma BRAF MUTfattore predittivo positivo per vemurafenib Hpv typing su lesioni ano genitali per rischio di svìluppo carcinoma Pancreas kras fattore diagnostico Ricerca mRNA miRNA lesioni cerebrali Tipizzazione genetica

Progetti di ricerca - 1 Tumori Cerebrali Analisi degli effetti del trattamento su una linea cellulare di Medulloblastoma: analisi del miRNOMA Ricerca di markers molecolari per fini prognostici-predittivi Tumori tiroidei Caratterizzazione molecolare, analisi mutazionale di potenziali markers molecolari DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria

Progetti di ricerca - 2 Sclerosi laterale amiotrofica Isolamento, caratterizzazione e analisi miRNOMA di pazienti SLA Tumori Pancreatici Profilo molecolare di carcinomi pancreatici lungo sopravviventi Tumori ipofisari Ricerca di markers molecolari per diagnostica differenziale di lesioni ipofisarie DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria

Tecniche - 1 Tecniche mutazione-specifiche Es. Allele-specific PCR per le mutazioni più frequenti di KRAS, BRAF e IDH1 Real-Time ABI7000 Es. Campione KRAS G12D High Resolution Melting (HRM) Es. Screening mutato/non mutato per KRAS e EGFR Light Cycler 480 (Roche) DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria

Tecniche - 2 Sequenziamento Sanger si analizza tutta la regione di interesse sensibilità 20% Next Generation sequencing sensibilità 1% parallel sequencing high-throughput CEQ2000 XL (Beckman Coulter) Es. Campione KRAS G12D 454-GS Junior (Roche) DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria

Cosa NON facciamo Trasfezioni Colture cellulari Saggi enzimatici Studi in vivo

Requisiti Tempo richiesto: almeno 9 mesi Orario Lavorativo: dalle 9 alle 17, dal Lunedì al Venerdì Tirocinio Assolto Esami: finiti o massimo un paio mancanti

Staff & Info Prof.ssa Annalisa Pession DIPARTIMENTO DI FARMACIA E BIOTECNOLOGIE - FaBiT Laboratorio Biologia Molecolare - Ospedale Bellaria Staff & Info Chi siamo: Prof.ssa Annalisa Pession annalisa.pession@ausl.bologna.it Dr.ssa Michela Visani PhD (Borsista) michela.visani@unibo.it Dr. Dario de Biase PhD (Borsista) dario.debiase@unibo.it Dr.ssa Giorgia Acquaviva (Borsista) giorgia.acquaviva2@studio.unibo.it Dove siamo: Laboratorio di Biologia Molecolare Anatomia Patologica, Ospedale Bellaria Via Altura 3, Bologna Linea bus: 36, 90