ESERCITAZIONE PROSITE & INTERPRO
Prosite
Elenco dei motivi in PROSITE
Funzioni coinvolgenti ZINCO ZINC
Motivo funzionale LIM
Descrizione di LIM
Descrizione con 2 tipi di motivi Profilo Espressione regolare
Espressione regolare per LIM Selettività Sensitività Espressione regolare Elenco veri positivi
Matrice di Profilo per LIM Possibili aminoacidi 61 Posizioni sulla sequenza
Descrizione con 2 tipi di motivi Allineamento multiplo Organizzazione in domini dei veri positivi
Allineamento multiplo per LIM
Architettura in domini
ScanProsite
2 tipi di ricerche MKGLLWSKNRKSSTASASSSSTSTSHKTTTA STASSSSPSSSSQTIRNSTSGASPYMHSH HHHGQGHSHHRGEDNNRDKRKSSVFPPSK QYTSTSSSQVNLGMYHSDTNTRSSRSIASTL KDDSPSVCSEDEISNSSSQKSNAQDETPIAYK KSAHSKDSLLPSRSSSLSPPQSRCSTGT C-X(2)-[CH]-[AIL]-T Per sequenza Per motivo funzionale
Ricerca per sequenza xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx incollare sequenza di CSKP_HUMAN
6 Motivi trovati Motivo trovato Posizioni/e
Ricerca di un motivo C-X(2)-[CH]-[AIL]-T-C Espressione regolare Banche dati solo SP senza varianti di splicing
53 sequenze positive trovate Proteina trovata Posizione motivo
INTERPRO
INTERPRO SCAN xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx incollare sequenza di CSKP_HUMAN
Risultati ricerca