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TECNICHE DELLA RICERCA NELLE BANCHE DATI ONLINE Gaetano Grillo Biblioteca “Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie Corso di formazione Tutoriale.

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1 TECNICHE DELLA RICERCA NELLE BANCHE DATI ONLINE Gaetano Grillo Biblioteca “Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie Corso di formazione Tutoriale – 1° ed. Torino, 6 marzo 2008

2 Breve introduzione Medline (OVID) Cinahl (OVID) Embase (OVID) The Cochrane Library (OVID) Reperire la letteratura trovata Il Programma di oggi

3 Le esigenze informative di partenza - Tenermi aggiornato su un argomento? - Tesi di laurea o altro lavoro scientifico? - Relazione per un esame? - Descrizione o gestione di casi clinici? - Relazione sulla propria attività o su quella del reparto? - altro… ?

4 I tipi di documento: -libri monografici (trattati, manuali, raccolte di saggi) - periodiciperiodici - linee guidalinee guida - atti di congressiatti di congressi - immagini (fisse e in movimento) - documenti multimediali altro...?

5 I formati possono essere: -Cartacei - elettronici con accesso locale (CD- ROM, Floppy disk, …) - elettronici con accesso remoto (CD- ROM in rete, siti Internet, fulltext online)

6 Strumenti di ricerca - Database bibliograficiDatabase bibliografici - CataloghiCataloghi - Subject gatewaysSubject gateways - Motori di ricercaMotori di ricerca - Mailing list e rispettivi archiviMailing list e rispettivi archivi - Forum di discussioneForum di discussione - Siti di associazioni professionaliSiti di associazioni professionali

7 Le fonti per la ricerca bibliografica online in ambito biomedico:

8 I database: definizione La gestione dell’informazione è lo scopo principale di un databasedatabase Esso è un insieme di descrizioni standard, strutturate e organizzate, accessibile all'utenza attraverso interfacce che ne permettano l'interrogazione e il recupero di dati

9 Una tabella di database Sono visibili i campi (colonne) in verticale e i record (righe) in orizzontale

10 Relazione tra tabelle Esempio di database relazionale, in cui le tabelle sono collegate tra loro

11 Ricercare in un database bibliografico Vanno distinti: - la struttura del database - il software di IR (= information retrieval, recupero dell’informazione)

12 Cosa sono i database bibliografici? In un database bibliografico i dati sono divisi in campi e record. I record rappresentano le citazioni bibliografiche (che derivano dallo spoglio di articoli di riviste prese in considerazione dal database) Per ogni articolo viene prodotta una citazione bibliografica che comprende una serie di elementi (metadati). Questi riferimenti bibliografici sono relativi alla letteratura biomedica (prevalentemente periodici) Le singole citazioni bibliografiche sono organizzate in campi (Autore, titolo, rivista …)

13 MEDLINE: La NLM

14 MEDLINE è la più importante banca dati bibliografica mondiale di argomento biomedico e contiene citazioni e abstract di più di 5000 riviste biomediche (in 37 lingue) pubblicate negli Stati Uniti e in altri 80 paesi MEDLINE è la più importante banca dati bibliografica mondiale di argomento biomedico e contiene citazioni e abstract di più di 5000 riviste biomediche (in 37 lingue) pubblicate negli Stati Uniti e in altri 80 paesi Prodotto dalla National Library of Medicine in lingua inglese Prodotto dalla National Library of Medicine in lingua inglese Argomenti: Medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria … Argomenti: Medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria … Contiene oltre di riferimenti bibliografici di articoli pubblicati su riviste dal 1950 a oggi Contiene oltre di riferimenti bibliografici di articoli pubblicati su riviste dal 1950 a oggi Aggiornamento quotidiano Aggiornamento quotidiano E‘ gratuita tramite l‘interfaccia di Pubmed dal 1997 E‘ gratuita tramite l‘interfaccia di Pubmed dal 1997 MEDLINE

15 Caratteristiche di MEDLINE Tipo di documenti indicizzati: articoli di rivista (gli atti di congresso compaiono solo se pubblicati su riviste).Tipo di documenti indicizzati: articoli di rivista (gli atti di congresso compaiono solo se pubblicati su riviste). Copertura geografica: circa il 50% degli articoli appartiene a riviste pubblicate negli Stati Uniti, il restante 50% a riviste pubblicate in 80 altri PaesiCopertura geografica: circa il 50% degli articoli appartiene a riviste pubblicate negli Stati Uniti, il restante 50% a riviste pubblicate in 80 altri Paesi Copertura linguistica: il 78% degli articoli indicizzati in MEDLINE è scritto in lingua inglese, ma questa percentuale sale all’89% per gli articoli inseriti tra 2000 e 2003Copertura linguistica: il 78% degli articoli indicizzati in MEDLINE è scritto in lingua inglese, ma questa percentuale sale all’89% per gli articoli inseriti tra 2000 e 2003

16 Caratteristiche di MEDLINE Lingua d’interrogazione è l’inglese, anche per reperire riferimenti ad articoli pubblicati in lingue diverse (il titolo dell’articolo, in questi casi, è tradotto in inglese) Presenza di abstract: tutti i riassunti presenti sono in inglese, indipendentemente dalla lingua in cui è scritto l’articolo Frequenza di aggiornamento? Quotidiana; ogni giorno vengono aggiunti 2000 – 4000 nuovi record. Nel 2006, sono stati aggiunti nuovi record

17 Caratteristiche di MEDLINE Quali tipi di studio si trovano? Tendenzialmente tutti quelli pubblicati sulle riviste: lettere che esprimono opinioni report di casi singoli o di più casi studi qualitativi sperimentazioni non controllate studi di eziologia, studi prospettici sperimentazioni precliniche e cliniche controllate: studi caso-controllo, sperimentazioni randomizzate controllate, ecc. Revisioni narrative e sistematiche Linee guida

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19 MEDLINE IN OVID

20 Esistono diverse piattaforme per interrogare il database MEDLINE: Gratuite : Entrez PUBMEDEntrez PUBMED A pagamento: OVIDOVID In OVID e in PUBMED sono interrogabili anche altre banche dati. OVID è accessibile da tutti i PC aziendali e universitari Da casa: tramite il proxy (Nome utente e password sono gli stessi usati per l'accesso al servizo di posta elettronica dell'Ateneo) proxy

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26 Struttura di una citazione / 1 I record (le singole citazioni bibliografiche) sono organizzati in campi. Ecco i principali: autore (fino a 25 cognomi); titolo dell'articolo (e parole del titolo); descrittori di soggetto (sono detti MeSH, ovvero "Medical Subject Headings") e rappresentano l'argomento di ogni singolo articolo; abstract (riassunto);

27 Struttura di una citazione / 2 fonte bibliografica (titolo della rivista in forma abbreviata, anno, volume, fascicolo, pagine); ente di appartenenza e indirizzo del primo degli autori dell'articolo; lingua originale in cui l'articolo è stato pubblicato; tipo di pubblicazione (ad es. lettera, editoriale, rassegna).

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29 I descrittori di soggetto: I MeSH, ("Medical Subject Headings") MESHMESH è l'acronimo di Medical Subject Headings, ovvero intestazioni di soggetto per la medicina e servono ad identificare i termini più appropriati per la ricerca. Ne esistono circa 24,767 (ott. 2007) e sono scelti da specialisti di ogni area della biomedicina.

30 I descrittori di soggetto: I MeSH, ("Medical Subject Headings") Si tratta di un tesauro… (Thesaurus = vocabolario controllato). I suoi descrittori fanno parte di una struttura gerarchica che permette di ricercare a vari livelli di specificità. Gli articoli sono indicizzati utilizzando questo tesauro e quindi: i termini sono in forma normalizzata (tutti i sinonimi sono ricondotti ad un unico termine accettato. Es: tumor, neoplasm, cancer, cancers…  “Neoplasms”) i termini sono collegati con una rete di rinvii. In particolare: “vedi”: rinvio da voce non accettata a voce accettata: es.: “cancer”  vedi Neoplasms “Vedi anche”: per i termini, entrambi accettati, che hanno una relazione importante. es.: Surgery, operative vedi anche intraoperative complications operating rooms i termini sono disposti in una gerarchia “ad albero”, in cui i “broader terms” (termini più generali) contengono i “narrower terms”, termini più ristretti)

31 Conoscere la struttura dei MeSH può essere molto utile per elaborare una ricerca efficace Le 16 categorie principali del MeSH : 1. Anatomy [A] 2. Organisms [B] 3. Diseases [C] 4. Chemicals and Drugs [D] 5. Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment [E] 6. Psychiatry and Psychology [F] 7. Biological Sciences [G] 8. Natural Sciences [H] 9. Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena [I] 10. Technology, Industry, Agriculture [J] 11. Humanities [K] 12. Information Science [L] 13. Named Group [M] 14. Health Care [N] 15. Publication Characteristics [V] 16. Geographicals [Z]

32 I MeSH : accorgimenti I MeSH non sono disponibili su: premedline “record as supplied by publisher” I MeSH non vengono creati per argomenti che ricorrono raramente I MeSH non esistono ancora per i termini “nuovi” N.B. In tutti questi casi usare la ricerca libera con operatori logici.

33 I MeSH RIASSUMENDO: Ogni articolo indicizzato riceve un certo numero di descrittori MeSH che definiscono il suo intero contenuto semantico Alcune voci di soggetto hanno una particolare rilevanza (indicate, nei record bibliografici, con l'asterisco (*)). Queste voci si ricercano specificando come qualificatore [MAJR].

34 PRIMA DI INIZIARE LA RICERCA FORMULARE IL QUESITO USANDO IL PICO Patient group(s) (paziente) Il quesito riguarda chi o che cosa (problema)? Intervention (intervento) Che cosa è stato fatto o succede ai pazienti? Comparison(s) (comparazione) Che cosa potrebbe essere fatto in alternativa? Outcome(s) (esito) Come influisce l’intervento sulla popolazione/pazienti?

35 Ricerca di base

36 Ricerca avanzata Inserisco un nuovo termine per la ricerca decubitus

37 il DB suggerisce a quali termini MeSH si lega, e seleziono il termine che mi interessa Termine libero

38 L’albero MeSH

39 I SUBHEADINGS Le "sotto-intestazioni" rappresentano un aspetto particolare del singolo descrittore MeSH a cui si applicano. Sono utili per rendere efficace una strategia di ricerca. Se cerchiamo, ad esempio, una sostanza farmacologica, potremmo essere interessati a circoscrivere i risultati della ricerca all'aspetto tossicologico, oppure agli effetti collaterali, al suo uso diagnostico o terapeutico, al suo assorbimento e metabolizzazione da parte dell'organismo, agli avvelenamenti, alla posologia, e via dicendo. Non tutti i subheadings sono applicabili a tutti i MESH

40 Subheading: visualizzazione dettagliata

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45 Come limitare una ricerca: i “Limits” Conviene partire sempre da una ricerca più ampia e restringerla, ad es. per: gruppi d’età (attenzione alle definizioni!) data di pubblicazione dell’articolo data d’inserimento del record nel database (Entrez date, per le novità)

46 I limiti metodologici Indicano il tipo di pubblicazione, es.: Clinical Trial Editorial Randomized Controlled Trial Servono a individuare il livello di evidenza presentato in uno studio Lista rapida: sotto “limits”

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50 L’uso degli operatori boleani: AND, OR, NOT Per una buona strategia di ricerca utilizzando i MeSH è necessario l’uso metodico degli operatori logici boleani. La combinazione di AND, OR e NOT per associare più termini nella stessa ricerca, permette di risolvere il problema dei risultati con troppi record (è sbagliata l’idea che tanti articoli recuperati equivalgano ad una buona ricerca)

51 Come si impiegano gli operatori boleani? Per comprendere l'"algebra" booleana (AND, OR e NOT) si tengano presenti le seguenti relazioni grafiche: L'AND "restringe" l'insieme ai risultati comuni ad un secondo insieme a AND b

52 l'OR lo "allarga" sommandovi il secondo insieme a OR b il NOT elimina dal primo quanto appartiene anche al secondo. a NOT b

53 In pratica: l’AND equivale ad un'intersezione; l'OR ad una sommatoria; il NOT ad una sottrazione.

54 CINAHL : che cosa contiene?

55 CINAHL Il Cumulative Index to Nursing & Allied Health è un database comprendente riferimenti bibliografici da pubblicazioni appartenenti alle discipline infermieristiche e alle scienze alleate Le varie specialità dell’infermieristica: Chirurgia Chirurgia plastica Fisioterapia e riabilitazione Gastroenterologia Ginecologia Nutrizione e dietetica Oncologia Discipline collaterali: Assistenza medica Optometria Pediatria Pronto soccorso Servizio sociale nella cura della salute Tecnica radiologica Terapia occupazionale Tecnica chirurgica

56 E’ tra i più vecchi e completi repertori bibliografici delle scienze infermieristiche Prodotto dall’American Nurses Association e dalla National League for nursing Nato nel 1961 (indicizzando 35 periodici) con il nome di CINL vede la sua veste definitiva nel 1977, integrato con la letteratura di discipline collaterali CINAHL: un po’ di storia

57 CINAHL: contenuti Copertura temporale: dal 1982 in poi Copertura geografica: Africa, Asia, Australia, Canada, Europa, Sud America, Regno Unito e Irlanda, Stati Uniti Indicizza 2,593 riviste, di cui 1,798 includono il riassunto dell ’ autore; inoltre: tesi, linee guida (a volte in testo completo), atti di congressi, materiali audiovisivi, software e libri Sono presenti 1,328,745 record (dato dic. 2006) Il database è indicizzato con un tesauro. Il 70% del CINAHL subject headings (12,414 ) corrisponde ai MeSH del MEDLINE; gli altri termini sono specifici per l ’ infermieristica e le scienze alleate

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66 Embase: che cosa contiene?

67 EMBASE Banca Dati bibliografica che copre i settori della medicina, con particolare riguardo alla farmacologia e alla tossicologia Piú di records a partire dal 1974 (nella versione OVID dal 1988) 5000 riviste, di prevalenza europea aggiornamenti giornalieri Europa Thesauro: EMTREE (52,500 termini) A pagamento

68 Paragone tra EMTREE e MeSH

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70 The Cochrane Library La Cochrane Library é una pubblicazione elettronica finalizzata a rendere disponibile la migliore evidenza per le domande terapeutiche E’ il principale prodotto della Cochrane Collaboration e raccoglie tutte le sue revisioni sistematiche (RS) prodotte ed i protocolli delle revisioni in corso. “Si tratta di un'efficiente e valida fonte di informazione per professionisti impegnati in scelte di governo clinico, utili nell'orientare le attività mediche ed infermieristiche, nell'educazione continua e nell'organizzazione dei servizi”

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72 Le revisioni Cochrane sono esclusivamente revisioni di studi clinici randomizzati, identificati su tutte le più importanti riviste mediche pubblicate nelle diverse lingue. L’inclusione o l’esclusione degli studi è basata su espliciti criteri di qualità in modo da ridurre gli errori sistematici. Spesso i dati vengono combinati statisticamente (con le meta- analisi) per raggiungere risultati più affidabili ( a volte i singoli studi includono casistiche troppo piccole). Nuove revisioni sono rese disponibili ad ogni edizione della Cochrane Library con l'obiettivo finale di coprire tutte le aree della assistenza sanitaria. Cochrane Database of Systematic Reviews (Cochrane Reviews)

73 Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness (DARE) Il DARE contiene 5758 abstract strutturati di revisioni sistematiche pubblicate sulle maggiori riviste mediche e analizzate qualitativamente da esperti del NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York, Inghilterra. The Cochrane Centre Register of Controlled Trials (CENTRAL) E’ una bibliografia di trial clinici identificati dai membri della Cochrane Collaboration tramite la ricerca manuale delle riviste biomediche internazionali. Lo scopo finale è creare una banca dati esaustiva degli studi clinici controllati. CENTRAL si basa sull'esame sistematico di atti dei congressi e su molte altre fonti non incluse in MEDLINE o in altre banche bibliografiche.

74 NHS Economic Evaluation Database (NHS EDD) L’ NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York produce questa banca dati di riassunti sulla valutazione economica degli interventi sanitari. Health Technology Assessment Database (HTA) Questa banca dati, prodotta dal NHS Centre for Reviews and Dissemination della University of York, raccoglie informazioni in merito a studi internazionali di health technology assessment. Contiene 4733 record riferibili a studi già completati o in corso. I riassunti provengono dall’International Network of Agencies for Health Technology Assessment (INAHTA) ed hanno un carattere più descrittivo che analitico. Non riportano valutazioni critiche del contenuto.

75 I DB della Cochrane Library Record Counts DatabaseTotal Records Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR; Cochrane Reviews)Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR; Cochrane Reviews) * 5171 Database of Abstracts of Reviews of Effects (DARE; Other Reviews) 7048 Cochrane Central Register of Controlled Trials (CENTRAL; Clinical Trials) 527,885 Cochrane Methodology Register (CMR; Methods Studies) 10,191 Health Technology Assessment Database (HTA; Technology Assessments) 7177 NHS Economic Evaluation Database (NHSEED; Economic Evaluations) 22,978 About The Cochrane Collaboration (About; Cochrane Groups)About The Cochrane Collaboration (About; Cochrane Groups) † 92

76 Un po‘ di storia 1972 Archie Cochrane (Epidemiologo) sosteneva l‘importanza di creare un registro centrale internazionale di studi clinici in particolare quelli Randomizzati, i soli che erano il più possibile esenti da “bias”. Egli scriveva:“E' davvero una critica giusta quella che viene fatta alla nostra professione, di non aver organizzato un sommario critico, specialità per specialità, aggiornato periodicamente, di tutti gli Studi Randomizzati Controllati rilevanti”. Alcuni anni dopo la sua morte questa riflessione portò alla creazione della Cochrane Collaboration

77 La „Cochrane Collaboration“ La Cochrane Collaboration é una rete internazionale di scienziati e medici. Il fine di questa istituzione é di produrre revisioni sistematiche per poter valutare terapie, tenerle aggiornate e diffonderle Le revisioni vengono prodotte da diversi gruppi di revisione La Cochrane Collaboration è un organizzazione senza scopo di lucro

78 Esempi di gruppi di revisione Anaesthesia Group Back Group Bone, Joint and Muscle Trauma Group Breast Cancer Group Childhood Cancer Group Colorectal Cancer Group Consumers and Communication Group Cystic Fibrosis and Genetic Disorders Group Dementia and Cognitive Improvement Group Depression, Anxiety and Neurosis Group Developmental, Psychosocial and Learning Problems Group Drugs and Alcohol Group

79 Riassumendo : La Ricerca avviene in modo tematico Ad ogni articolo viene assegnato un certo numero di soggetti, che descrivono il suo contenuto Esistono Major und Minor Subjects Major subject: si riferiscono al tema centrale dell‘articolo Minor Subjects: il tema viene solo accennato Le "sotto-intestazioni“ (subheadings) rappresentano un aspetto particolare del singolo descrittore

80 Medline (in OVID) CINAHL (in OVID) EMBASE (in OVID) CHOCHRANE LIBRARY (in OVID) dal dal dal riviste2.600 riviste5.000 rivisteFonti diverse angloamericanainternazionaleeuropeainternazionale MeSHCINAHL headingsEMTREE keywords Parola libera Articoli di rivisteArticoli di riviste, libri, tesi, audiovisivi Articoli di riviste Revisioni sistematiche, studi clinici Biomedicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria Infermieristica e scienze affini Biomedicina, farmaci e farmacologia Terapie

81 Linee Guida per la pratica clinica NGC - National Guideline Clearinghhouse E’ un database di linee guida americane Tutte hanno un abstract strutturato Di alcune esiste anche il full text Una certa quantità *non* si trova in PubMed (non sono pubblicate su riviste) Navigabili per: Disease/Condition Treatment/Intervention Organization Usare la “detailed search” Altre risorse: NELH's Guidelinesfinder (FT gratuito) NELH's Guidelinesfinder Programma Nazionale Linee Guida

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83 Linee Guida per la pratica clinica Guidelines.gov E’ un database di linee guida americane Tutte hanno un abstract strutturato Di alcune esiste anche il full text Una certa quantità *non* si trova in PubMed (non sono pubblicate su riviste Navigabili per: Disease/Condition Treatment/Intervention Organization Usare la “detailed search”

84 OVID: manuali online In OVID ho la possibilità di accedere a 41 libri in versione elettronica, di cui 22 hanno pertinenza infermieristiche

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88 I cataloghi delle biblioteche Come recuperare la documentazione scientifica selezionata? Nei cataloghi cartacei e in linea delle biblioteche biomediche trovo principalmente i riferimenti bibliografici a libri, periodici cartacei ed elettronici Attraverso il sito: accesso a: Catalogo periodici e dei libri della Biblioteca del Rosmini, al Catalogo periodici Biblioteche biomediche Università di Torino (OCAP) e (per le riviste disponibili in formato elettronico dell‘Ateneo di Torino)http://www.lsmolinette.unito.it/biblioteca/biblioteca.htmCatalogo periodici Biblioteche biomediche Università di

89 I cataloghi delle biblioteche Ulteriori strumenti di recupero dell’informazione: CATALOGO ITALIANO DEI PERIODICI (ACNP) ser/start/it/cnr/fp.html LibrinLinea (SBN - Catalogo collettivo delle biblioteche della Regione Piemonte) SBN-ONLINE nazionale

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95 I Periodici elettronici Il periodico elettronico, in alternativa al formato cartaceo, fornisce il testo completo di un documento (solitamente per leggere a video un articolo è preferibile usare il formato HTML e per la stampa il formato PDF) Strumento utile per reperire i loro siti è la lista alfabetica del PEB (Periodici Elettronici Biomedici) creata da bibliotecari biomedici

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97 I Periodici elettronici Possibilità d’accesso al full-text (testo integrale): Free - es.BMJ (Vedi lista dei periodici elettronici biomedici ad accesso gratuito Free Medical Journal )http://www.freemedicaljournals.com/htm/index.htm A pagamento con licenza o abbonamento* Nella nostra realtà è disponibili la lista: delle riviste elettroniche biomediche disponibili attraverso licenze con gli editori e della condivisione dei periodici elettronici in abbonamento [link presente nel sito della Biblioteca del Rosmini alla voce “Riviste online”]http://biblio.med.unito.it/periodici.shtml * Per accedere ai FT dei periodici elettronici occorre andare in biblioteca, oppure consultarli dai computer dell’Università e dell’Azienda Molinette o utilizzare la piattaforma e-learning (accesso al testo integrale solo di OVID FULL TEXT) o tramite l’ impostazioni del proxy per consultazione Banche Dati piattaforma e-learning impostazioni del proxy per consultazione Banche Dati

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106 RISORSE INTERNET SELEZIONATE ELISIRELISIR :Electronic Library of International Selected Internet Resources (Catalogo italiano di risorse Internet biomediche, creato da bibliotecari, con copertura anche dei siti infermieristici (70 c.a.), selezionati dalla biblioteca del Rosmini). Queste risorse sono state riversate nel nuovo catalogo di Ateneo PREFERITOPREFERITO

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