Divisione in gruppi di 3 (6) persone (ulteriormente suddivise in 3 coppie) Assegnazione di tre articoli originali per gruppo. Gli articoli sono divisi in tre tematiche (A, B, C) Ciascuno studente (coppia) del gruppo sceglie uno dei tre articoli da presentare in un breve seminario secondo un calendario prestabilito. Gli altri componenti del gruppo dovranno prepararsi a rispondere a domande (semplici) sull’articolo alla fine del seminario dei compagni di gruppo Seminari degli studenti

Seminario da 0 a 5 Domande ai componenti dello stesso gruppo di chi presenta (una per seminario) da 0 a 2 Esame finale da 8 a 21 Altri elementi che potranno contribuire al voto finale: 1) interventi durante la discussione dei seminari, 2) presenze VALUTAZIONE

articoli originali rassegne “reviews” libri di testo enciclopedia Letteratura scientifica

CELL EMBO J EUR J BIOCHEM J BIOL CHEM MOL CELL BIOL NATURE SCIENCE IMPACT FACTOR CITATION INDEX Citazioni per anno Indice h INDICATORI BIBLIOMETRICI

Genoteche e banche di cDNA

Trasferimento (blot)

Ibridazione

Western blot

Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

Schema di Northern blot

Analisi di espressione (mRNA)

Altre tecniche di analisi Estensione del primer (primer extension) Protezione dalla S1/RNasi (mapping) RT-PCR Real time PCR

mRNA totale oligo antisenso marcato mRNA globina cap 5’5’3’3’ ibridazione estensione con RT Analisi dei frammenti estesi su gel di sequenza frammento protetto Estensione del primer (primer extension)

Protezione da RNasi (RNase Protection)

mRNA totale sonda RNA antisenso mRNA globina cap 5’5’3’3’ ibridazione trattamento con RNasi Analisi dei frammenti protetti su gel di sequenza frammento protetto

Protezione da RNasi (RNase Protection)

Microarray (profilo trascrizionale)

Profilo differenziale mediante microarray

Tecniche di analisi di interazione DNA(RNA)-Proteine Foot-printing EMSA (electrophoretic mobility shift assay) Chromatin immunoprecipitation (CHIP)

Analisi interazioni DNA-proteine: saggio di footprinting

Analisi interazioni DNA-proteine: saggio EMSA

Analisi interazioni DNA-proteine: saggio EMSA

Chromatin immunoprecipitation (Chip)

Chip in lievito per Gal4 e Sug1

Coimmunoprecipitazione

Affinity co-purification (pull down)

Sistema dei due ibridi

Sistema dei tre ibridi

Sistemi (sperimentali) di espressione In vitro: - estratti cellulari In vivo: - cellule procariotiche - cellule eucariotiche in coltura - animali transgenici

Gene reporter

Vettori di clonaggio per lievito

Ricombinazione omologa

Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005

Vettori episomali

transiente stabile Trasfezione di cellule in coltura vettori plasmidici vettori virali vettori episomali siRNA

Watson et al., BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2005