Struttura del ribosoma

Immagini del ribosoma al microscopio elettronico modello fine anni 70

Caratteristiche strutturali del ribosoma

Frank et al., Nature (1995). Yellow: 30S subunit, blue: 50S subunit. The ribosome of E coli at 25 A resolution (cryo-electron microscopy of single ribosomesand reconstruction using 4300 projections) Frank et al., Nature (1995). Yellow: 30S subunit, blue: 50S subunit.

Nobel per la Fisiologia e Medicina 1974 Albert Claude Christian de Duve George E. Palade Premiati per la scoperta dei ribosomi

Nobel per la Chimica 2009 Venkatraman Ramakrishnan Thomas A. Steitz Ada E. Yonath Premiati gli studi su struttura e funzioni dei ribosomi

Cristalli della subunità 50S di Deinococcus radiodurans

Le subunità 30S e 50S del ribosoma procariotico

Siti attivi del ribosoma

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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RNA messaggero

I poliribosomi (polisomi)

La traduzione (sintesi proteica)

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La reazione di peptidil-trasferasi

Amminoacil-tRNA occupano i siti A e P

Il polipeptide nascente è trasferito

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Fasi della traduzione

Fasi della traduzione

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Inizio della traduzione nei procarioti

Fattori di inzio in E.coli: IF1 IF2 IF3 (IF = Initiation Factor)

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Il Met-tRNA iniziatore è formilato tetraidrofolato tetraidrofolato

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Il gruppo formilico e talvolta la metionina vengono eliminati

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La sequenza di Shine-Dalgarno

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Traduzione degli mRNA policistronici nei procarioti 5' 5'

Inizio della traduzione negli eucarioti

Struttura degli mRNA

Initiation Factors prokaryotes eukaryotes Activity prokaryotes eukaryotes IF3 eIF-1 Fidelity of AUG codon recognition IF1 eIF-1A Facilitate Met-tRNAiMet binding to small subunit eIF-2 Ternary complex formation eIF-2B (GEF) GTP/GDP exchange during eIF-2 recycling eIF-3 (12 subunits) Ribosome antiassociation, binding to 40S eIF-4F (4E, 4A, 4G) mRNA binding to 40S, RNA helicase activity eIF-4A ATPase-dependent RNA helicase eIF-4E 5' cap recognition eIF-4G Scaffold for of eIF-4E and -4A eIF-4B Stimulates helicase, binds with eIF-4F eIF-4H Similar to eIF4B eIF-5 Release of eIF-2 and eIF-3, GTPase IF2 eIF5B Subunit joining eIF-6 Ribosome subunit antiassociation

La sequenza consenso di Kozak

Formazione di complessi nell'inizio della traduzione negli eucarioti: - complesso ternario - complesso 43S - complesso del cap - complesso 48S - complesso 80S { A B C

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Negli Eucarioti eIF-2 forma un complesso ternario con Met-tRNAf Il complesso ternario lega la subunità 40S libera che si lega all’estremità 5’ dell’mRNA GTP viene idrolizzato quando eIF2 viene rilasciato come eIF2-GDP eIF-2B rigenera la forma attiva. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006