Struttura "modulare" degli attivatori legame al DNA transattivazione dimerizzazione legame al ligando

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Struttura degli attivatori

Scambio di domini di attivatori

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Dominio Dito di Zinco

Omeodominio (HTH, Elica-giro-Elica)

Dominio Elica-Ansa-Elica (bHLH)

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Famiglie di fattori di trascrizione Dito di zinco (zinc finger) Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) Elica-ansa-elica (helix loop helix, bHLH) Cerniera di leucina (leucine zipper, bZIP)

Dimerizzazione degli attivatori

Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri

Struttura dell’ “Enhanceosoma”

Attivazione della trascrizione mediante reclutamento

Attivazione della trascrizione

Modificazioni della cromatina mediate dagli attivatori

Acetilazione e deacetilazione della cromatina Corepressore

Gli attivatori sono "bersaglio" di vie di trasduzione

Terminazione della trascrizione nei procarioti

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Terminatore intrinseco Due regioni palindromiche che formano una forcina di 7-20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente) G T C A U 5 ' 3 - H . C G A U - O H ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC GTTTT CAAAA AAAAAA TTTTTT A T G C U UUUUUU 5' 3' -OH ... GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 5' 3' G C UUUUUUUU -OH ... CCCA A U

Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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Terminazione rho-dipendente

Antiterminazione

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Attenuazione

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Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

Operone triptofano

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Il ribosoma influenza la formazione delle strutture

Peptidi leader di operoni "attenuati" codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi

Terminazione negli eucarioti

pol I e pol III pol II

La poliadenilazione degli mRNA eucariotici

CPSF riconosce seq. AAUAAA CstF lega GU, stimola CFI, CFII endonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein