Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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RETROELEMENTI Retrovirus Retrovirus endogeni (ERV) Retrotrasposoni (Ty1, Ty3, gypsy, copia, LINE, SINE)

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LINE (long interspersed nuclear element) Contengono trascrittasi inversa Derivano da trascritti pol II Es. LINE-1 (L1) 6,1 Kb 3500 copie intere e centinaia di migliaia tronche

SINE (short interspersed nuclear element) Non contengono trascrittasi inversa Derivano da trascritti di pol III Es. Alu Un milione di copie

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Quanti geni sono espressi? 10-20 mila geni sono espressi in ciascuna cellula 90% in comune tra i vari tessuti

Quanto sono espressi i geni? Un centinaio di mRNA sono abbondanti: 1000-10000 copie/cellula (50% dell’mRNA totale) Il resto (10 000) sono mRNA scarsi: meno di 10 copie/cellula

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Più della metà dei geni di lievito non sono indispensabili Geni ridondanti (famiglie geniche) Funzioni accessorie

Le famiglie geniche contengono più geni di quanto prevedibile dall’analisi delle proteine

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Pseudogeni = geni non funzionali Con introni (duplicati) Maturati (processati)

Origine degli pseudogeni

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Famiglia dei geni della globina nell’uomo e altri primati

Siti di sostituzione e siti silenti .Val.Cys.Arg.Ala.Pro. .Val.Cys.Leu.Ala.Pro. .GTG.TGT.CGA.GCT.CCA. .GTG.TGT.CTA.GCT.CCA. .GTG.TGT.CTT.GCT.CCA.

Divergenza di due geni (rpL4) separati da 30 milioni di anni (solo regione codificante)

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Organizzazione delle unità di ripetizione dei geni per gli istoni in diverse specie

Tutti i genomi contengono copie multiple dei geni per l’rRNA e per i tRNA

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I PRECURSORI DEGLI rRNA SONO PIU' LUNGHI DELLA SOMMA DEI DUE rRNA MATURI

I PRECURSORI DEGLI rRNA SONO PIU' LUNGHI DELLA SOMMA DEI DUE rRNA MATURI

I geni per gli rRNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici ETS 18S ITS 28S NTS RNA RNA DNA DNA gene promoter 60/81 bp repeats spacer other repetitive elements DNA