SKY e M-FISH

Multi-band

CGH (Comparative genomic Hybridization) Il DNA da studiare è marcato con un fluorocromo ed ibridato con un campione di DNA normale di controllo marcato con un diverso fluorocromo. Regioni sottorappresentate hanno segnale più debole perché legano meno sonda ed hanno colore diverso dalle regioni sovrarappresentate che legano più sonda. Sono utili nello studio dei riarrangiamenti cromosomici sbilanciati

CGH

Microarray

244K 244K 244K Last present probe First deleted probe Last deleted First present probe Deletion size 851 Kb 88.007 Mb 88.000 Mb 87,149 Mb 87.139 Mb 244K 244K 244K

PATOLOGIE GENOMICHE Patologie genomiche: sindromi cliniche dovute a guadagno (duplicazione) o perdita (delezione) di uno specifico segmento cromosomico. Solitamente sono caratterizzate da difetti congeniti e/o deficit neurologici e cognitivi. Nella maggior parte dei casi le caratteristiche cliniche sono il risultato della variazione nel numero di copie di geni contenuti nell’intervallo genomico interessato. Più raramente il fenotipo può essere determinato dalla rottura di un gene, dalla creazione di geni di fusione, da un effetto di posizione o dallo ”smascheramento” di una mutazione recessiva per la realizzazione di una emizigosità.

NEXT GENERATION SEQUENTING

ESAME DEL DNA

ESAME DEL DNA PREDITTIVO

DNA e MEDICINA FORENSE

I E R DNA O G I

ALTRI TEST DIAGNOSTICI PCR Quantitativa Real Time Test di Eterozigosità Consiste nello studio di un pannello di marcatori polimorfici (STR) che mappano all’interno della regione interessata. Se un marcatore è presente in doppia copia si può escludere la delezione del tratto che lo contiene, se è presente in singola copia ci possiamo trovare di fronte ad una delezione oppure ad una condizione di eterozigosità MLPA (Multiple Ligation-dependent Probe Amplification) Con questa metodica è possibile valutare contemporaneamente il numero di copie di più geni contenuti nella regione di interesse

IL LABORATORIO DI GENETICA “chiedere bene per ottenere molto” “chiedere a volte poco per ottenere molto”!

Diagnosi Prenatale

AFP + hCG + uE3 (+ inibina A) Integrato I trim.: NT + PAPP-A + I trimestre Epoca: 10+4 - 13+6 settimane NT + PAPP-A + free β hCG II trimestre Epoca: 15 - 22 settimane AFP + hCG + uE3 (+ inibina A) Integrato I trim.: NT + PAPP-A + II trim.: AFP + hCG + uE3 (+ inibina A) Test Combinato Duo-Test /Bi-Test Quadri-Test Tri-Test

Test predittivi ecografici

Detection rate (%) Età Età + AFP Età + AFP + hCG Età + AFP + hCG + uE3 Dott.F. Lonardo Detection rate (%) Età Età + AFP Età + AFP + hCG Età + AFP + hCG + uE3 I trim. Integrato

Il “superamento”dei test invasivi in gravidanza con esami genetici da sangue periferico della gestante Altri tessuti ? Una “carta d’identità” genetica…cioè la predisposizione individuale a ogni tipo di patologia

“Il Dottore” di Sir Luke Fildes, c.1891