DECIDE DECIDE ( Diagnostic Enhancement of Confidence by an International Distributed Environment ) Laura Leone - GARR DECIDE Project Coordinator Dalla.

Presentazione sul tema: "DECIDE DECIDE ( Diagnostic Enhancement of Confidence by an International Distributed Environment ) Laura Leone - GARR DECIDE Project Coordinator Dalla."— Transcript della presentazione:

1 DECIDE DECIDE ( Diagnostic Enhancement of Confidence by an International Distributed Environment ) Laura Leone - GARR DECIDE Project Coordinator Dalla ricerca neurologica alla pratica clinica: un e-Service Europeo per il supporto alla diagnosi delle neurodegenerazioni

2 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 2 Obiettivi del Progetto DECIDE un servizio per la diagnosi precoce di patologie neurodegenerative per la comunità Neuroscientifica (e-Infrastructure) una infrastruttura di rete, griglia, applicazioni un servizio sicuro e user-friendly Validare il servizio con casi reali garantire sostenibilità alla infrastruttura Divulgare i risultati/fornire programmi di formazione Promuovere l’adozione del servizio

3 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 3

4 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 4 The DECIDE project Contributo EC richiesto:~ 2.3 M€ Durata: 24 Months Iniziato il 1 September 2010 Sottomesso alla EC Call: FP7-INFRASTRUCTURES-2010-2 – Virtual Research Communities GARR fornisce il coordinamento Coordinamento Scientifico ad opera del principal investigator di neuGRID 13 Partners Europei + una rete europea dei maggiori network di neurologia, e associazioni europee di pazienti Tutti i partner coinvolti hanno competenze complementari a quelle richieste nel Progetto : dalla rete all’utente finale.

5 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 5 Piano di lavoro di DECIDE Schema di finanziamento I3 structure Networking Activities Overall coordination of the project (NA1) Creation of stable liaisons with relevant stakeholders in the scientific and e-Infrastructure domains (NA2) dissemination of results and reaching out to the medical community, (NA3) Service Activities Network and GRID provisioning and management (SA1) Exposing the medical database to the applications running on the e-Infrastructure (SA2) Research and development Activities Porting of the diagnostic alghorithms (JRA1) Design of the diagnostic service (JRA2) User validation and Testing (JRA3)

6 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 6 Partenariato 1 CONSORTIUM GARR Italy 3 CONSORZIO COMETA Italy Network and GRID Infrastructure Partners 2 CNR 6 UNIVERSITY OF GENOA - UNIGE Italy 7 UNIVERSITY OF FOGGIA - UNIFG Italy 9 MAAT FRANCE - maat G France 10 IMPERIAL COLLEGE– United Kingdom 11 UNIWERSYTET WARSZAWSKI - Poland Application Layer Partners 4 FATEBENEFRATELLI - Italy 5 UNIVERSITY SAN RAFFAELE - Italy 8 FONDAZIONE SDN - Italy 12 CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE TOULOUSE - France 13 ALZHEIMER EUROPE - Luxembourg Clinical and Patient Layer Partners Un innovativo approccio verticale alla e-Health, che risponde ai requisiti dei neuroscienziati attraverso la fornitura di una e-infrastruttura che li supporti nell’esecuzione quotidiana della diagnosi.

7 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 7 SA1 - Installation and maintenance of the enabling network and grid infrastructure SA2 - Exposure of and access to the reference databases JRA1 - Porting of the diagnostic algorithms JRA2 - Design of the Diagnostic Service JRA3 – User Validation and Testing La struttura di DECIDE

8 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 8 La strategia del Progetto Espandere l’accesso ad applicazioni altamente specializzate quali: CIVET/ADABoost – immagini RMI GridSPM – immagini Pet/SPECT EEG patterns Costruire un pilota di e-Service di referenza europea Fornire alle nuove comunità nuove performanti applicazioni Attualmente disponibili solo a pochi ricercatori.

9 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 9 E-Service finale

10 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 10 Da dove nasce DECIDE NeuGRID è l’ infrastruttura di riferimento con i suoi algoritmi basati su MRI che verranno importati in DECIDE OutGRID rappresenta l’apertura verso le infrastrutture Nord-Americane ( e.g. LONI, CBRAIN ) Ambedue OutGRID & NeuGRID forniranno a DECIDE i propri risultati Il Trasferimento dei risultati tra i progetti è assicurato dalla loro temporizzazione L’algoritmo GridSPM, PET/SPECT, è già sviluppato su scala nazionale con valore diagnostico

11 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 11 Le risorse iniziali- CPU & storage

12 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 12 Le risorse iniziali – data sets

13 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 13 I nostri requisiti : cosa ci serve Grandi database (nazionali, europei, mondiali) popolati di bioimmagini Molte risorse di calcolo per processare i dati Collaborazione con entità affini al Progetto Riscontro dalla comunità clinico/scientifica

14 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 14 GEANT & NRENs = EUROPEAN GATEWAY FOR RESEARCH Network access GÉANT collaboration & support EGI AND EMI STANDARDS AND COMMUNITY REQUIREMENTS Harmonization with EGI-EMI standards US-ADNI, NEST-DD MEDICAL PHARMACOG DATA COLLECTION Infrastructure and middleware standards Medical Data Collection DECIDE Ethical & legal, business model & extension DECIDE AUPs approval/authorization procedure Data collections neuGRID, LONI, CBRAIN, outGRID, EADC, PHARMACOG Algorithms, database, Grid repository, users Experts in Medical Physics, Mathematicians, Neurologists, Scientific international Collaboration DATA&EXPERTISEDATA&EXPERTISE DATA&EXPERTISEDATA&EXPERTISE Collaborazioni di DECIDE

15 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 15 Cooperazione e integrazione 1/2 Network Level collaboration with GEANT and the European NRENs community’s requirements European Grid Initiative (EGI) infrastructure and European Middleware Initiative (EMI) Standards UMD US-ADNI (US Alzheimer’s Disease Neuroimaging Iniziative) and NEST-DD (Network for Efficiency and Standardization of Dementia Diagnosis) Medical Data Collection compliance with common standards EADC, neuGRID, LONI, Brain Tuning, CBRAIN, outGRID, NEST-DD and ADDNEUROMED projects Further add other diagnostic algorithms

16 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 16 Cooperazione e integrazione 2/2 NeuGRID, CBRAIN, LONI and OutGRID North American/European standards Regolatorie legali ed etiche discovery/validation of neuroimaging markers PHARMACOG ( il più grande progetto europeo sullo studio dell’alzheimer)

17 Laura Leone – GARR Cernobbio – 1 Conferenza sulla Ricerca Sanitaria 17 Grazie per l ’ attenzione Per ulteriori informazioni Laura Leone laura.leone@garr.it http://www.eu-decide.eulaura.leone@garr.it http://www.eu-decide.eu