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STATISTICA F DI WRIGHT Suddivisione della popolazione eccesso di omozigosità Popolazione complessa è composta da I organismi individuali S sottopopolazioni.

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Presentazione sul tema: "STATISTICA F DI WRIGHT Suddivisione della popolazione eccesso di omozigosità Popolazione complessa è composta da I organismi individuali S sottopopolazioni."— Transcript della presentazione:

1 STATISTICA F DI WRIGHT Suddivisione della popolazione eccesso di omozigosità Popolazione complessa è composta da I organismi individuali S sottopopolazioni T popolazione totale

2 Si definiscono: STATISTICA F DI WRIGHT H I = eterozigosità media osservata tra le popolazioni H s = eterozigosità attesa della sottopopolazione secondo la legge di Hardy-Weinberg H T = eterozigosità attesa di una popolazione complessiva con accoppiamento casuale

3 H I = eterozigosità media osservata tra le popolazioni STATISTICA F DI WRIGHT Dato H i come eterozigosità della popolazione i, in caso di k popolazioni

4 H s = eterozigosità attesa della sottopopolazione secondo la legge di Hardy-Weinberg STATISTICA F DI WRIGHT Dato p i,s come frequenza dellallele i-esimo della sottopopolazione s, e H s come eterozigosità attesa della sottopopolazione secondo la legge di Hardy-Weinberg, allora e è la media delle H s di tutte le sottopopolazioni

5 H T = eterozigosità attesa di una popolazione complessiva con accoppiamento casuale STATISTICA F DI WRIGHT Dato come frequenza media dellallele i-esimo nella popolazione complessiva, allora

6 Con questi indici possiamo misurare: STATISTICA F DI WRIGHT F IS coefficiente di consanguineità 1) il coefficiente di consanguineità dovuto agli accoppiamenti non casuali allinterno della popolazione, mediante laumento dellomozigosità

7 2) lindice di fissazione, che rappresenta la perdita di eterozigosità di una popolazione suddivisa dovuta alla deriva genetica STATISTICA F DI WRIGHT F ST indice di fissazione notare perchè Se la popolazione totale è in equilibrio di Hardy-Weinberg

8 2pq Frequenza allelica (p) HTHT H SB H SA pApA pBpB Eterozigosità (H) STATISTICA F DI WRIGHT

9 Per misurare il coefficiente di consanguineità complessivo si può usare il parametro F IT che comprende sia la perdita di eterozigosità dovuta agli accoppiamenti non casuali allinterno della sottopopolazione (F IS ) sia la frammentazione della popolazione complessiva (F ST ): STATISTICA F DI WRIGHT

10 Sono state individuate nel Texas 43 sottopolazioni di Phlox cuspidata. Queste sottopopolazioni sono state studiate per quanto riguarda il gene Got-2 che possiede 3 alleli: Got-2*A, Got-2*B e Got-2*C. STATISTICA F DI WRIGHT: esempio 39 sottopopolazioni monomorfiche per Got-2*B 1 con frequenze Got-2*A = 0,37 e Got-2*B = 0,63 1 con frequenze Got-2*B = 0,87 e Got-2*C = 0,13 1 con frequenze Got-2*B = 0,82 e Got-2*C = 0,18 1 con frequenze Got-2*B = 0,91 e Got-2*C = 0,09 GOT = Glutamic-Oxaloacetic Transaminase I risultati sono stati:

11 frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , ,37 0, ,87 0, ,82 0, ,91 0,09 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio 0,00 0,17 0,09 0,06

12 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio

13 frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , ,37 0, ,87 0, ,82 0, ,91 0,09 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio 0,00 0,17 0,09 0,06 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16

14 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio e

15 frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , ,37 0, ,87 0, ,82 0, ,91 0,09 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio 0,00 0,17 0,09 0,06 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16 43

16 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio e

17 Coefficiente di consanguineità Indice di fissazione Coefficiente di consanguineità complessivo

18 0,00 0,17 0,09 0,06 frequenze n. stpopol. Got-2*A Got-2*B Got-2*C H oss H att , ,37 0, ,87 0, ,82 0, ,91 0,09 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio 0,00 0,47 0,23 0,30 0,16 43 Notare che

19 STATISTICA F DI WRIGHT: esempio H I = eterozigosità media osservata tra le popolazioni Che è uguale alleterozigosità attesa media di tutte le sottopopolazioni

20 Indice di fissazione Coefficiente di consanguineità Coefficiente di consanguineità complessivo STATISTICA F DI WRIGHT: esempio NOTA: lindice di fissazione e il coefficiente di consanguineità complessivo sono uguali è naturalmente uguale a zero


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