Definizioni: genoma trascrittoma proteoma.

Presentazione sul tema: "Definizioni: genoma trascrittoma proteoma."— Transcript della presentazione:

1 Definizioni: genoma trascrittoma proteoma

2 Struttura del genoma eucariotico
Sequenze ripetute Geni interrotti DNA non codificante

3 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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8 Cariotipi di due specie di Ranuncolaceae

9 Paradosso del valore C Eccesso di DNA rispetto alla complessità
Variazioni di valore C per complessità simili

10 Uniche Maggior parte dei geni (1-10 volte) 50-70% Geni reiterati in tandem (rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.) Mediamente ripetute (da centinaia a migliaia Alcune sequenze regolative di volte) intersperse 10-30% Alcune sequenze a funzione speciale (centromeri, origini, etc.) Altamente ripetute DNA satelliti (da decine di migliaia sequenze semplici a milioni di volte) 5-25%

11 geni per: rRNA (300) tRNA (1300) 5S RNA (2000) istoni (20) sequenze ripetute intersperse sequenza Alu: 300 nt (x ) sequenze semplici o satelliti: nt (x copie in tandem x blocchi interspersi)

12 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

13 Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici
Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.

14 La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire
con l'aumentare della grandezza del genoma

15 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

16 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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18 Gene per il collagene 1a2 di pollo

19 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

20 Esoni: sequenze rappresentate nell’RNA maturo
Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario

21 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

22 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

23 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

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25 L’ordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA
Gli introni dei geni nucleari hanno codoni di terminazione in tutti gli schemi di lettura