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Definizioni: genoma trascrittoma proteoma
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Struttura del genoma eucariotico
Sequenze ripetute Geni interrotti DNA non codificante
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Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Cariotipi di due specie di Ranuncolaceae
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Paradosso del valore C Eccesso di DNA rispetto alla complessità
Variazioni di valore C per complessità simili
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Uniche Maggior parte dei geni (1-10 volte) 50-70% Geni reiterati in tandem (rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.) Mediamente ripetute (da centinaia a migliaia Alcune sequenze regolative di volte) intersperse 10-30% Alcune sequenze a funzione speciale (centromeri, origini, etc.) Altamente ripetute DNA satelliti (da decine di migliaia sequenze semplici a milioni di volte) 5-25%
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geni per: rRNA (300) tRNA (1300) 5S RNA (2000) istoni (20) sequenze ripetute intersperse sequenza Alu: 300 nt (x ) sequenze semplici o satelliti: nt (x copie in tandem x blocchi interspersi)
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Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici
Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.
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La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire
con l'aumentare della grandezza del genoma
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Gene per il collagene 1a2 di pollo
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Esoni: sequenze rappresentate nell’RNA maturo
Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario
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L’ordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA
Gli introni dei geni nucleari hanno codoni di terminazione in tutti gli schemi di lettura
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