FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE L’approccio genomico non tiene conto di modificazioni post-traduzionali.

Slides:



Advertisements
Presentazioni simili
Metodi post-genomici in biochimica cellulare
Advertisements

IL PROGETTO GENOMA UMANO (HGP)
CROMATOGRAFIA …un po’ di teoria:
Il sistema italiano degli studi. nido Asilo nido 6 mesi - 3 anni.
Facoltà di Scienze MM.FF.NN.1 SCIENZA DEI MATERIALI (LT) Specificità e caratteristiche Il CdL recepisce lesperienze in campo europeo nellinsegnamento.
CHIMICA ANALITICA: È la scienza che estrae informazioni:
Elettroforesi su gel d’agarosio
LE PROTEINE SONO SOSTANZE ANFOTERICHE:
ELETTROFORESI CAPILLARE
PESI MOLECOLARI Uno dei problemi che si presenta sempre quando si studiano (bio)polimeri è quello della determinazione del peso molecolare. I polimeri.
Elettroforesi Separazione differenziata di molecole cariche (aminoacidi, peptidi, proteine, Acidi nucleici, ecc) sottoposte a un campo elelttrico.
Marco CristaniTeoria e Tecniche del Riconoscimento1 Notizie preliminari Introduzione Facoltà di Scienze MM. FF. NN. Università di Verona A.A
Metodi basati sulle similitudini per dedurre la funzione di un gene
APPROCCIO PROTEOMICO ALLO STUDIO DELL’INFERTILITÀ
UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI TRIESTE
richiede la possibilità di:
La prima dimensione : Isoelectric focusing (IEF)
Tecniche avanzate per l’analisi quantitativa del proteoma
Corso di Laurea in Ottica e Optometria, Università di Padova
Elettroforesi di Acidi Nucleici Southern e Northern Blot
Tramite ELETTROFORESI dimensione , carica o idrofobicita’ relativa.
Il clonaggio di un frammento di DNA
PCR (polymerase chain reaction)
MALDI BioTyper Arintha Biotech 2010/06.
Tecniche Analitiche Separative
informazioni & contatti
2a DIMENSIONE: SDS PAGE.
METODI VOLTAMMETRICI I metodi elettroanalitici che dipendono dalla misura di corrente contro potenziale applicato sono detti Metodi voltammetrici I metodi.
Equilibri chimici in soluzione acquosa
Titolare: Pierluigi Reschiglian
Titolare: Prof. Pierluigi Reschiglian
FACOLTA DI SCIENZE FF MM NN – ANALISI DI NANO E MICROSISTEMI Analisi di nano e microsistemi Titolare: Prof. Pierluigi Reschiglian Lauree Magistrali in:
FACOLTA DI SCIENZE FF MM NN – ANALISI DI NANO E MICROSISTEMI DISPERSI Analisi di nano e microsistemi dispersi Titolare: Prof. Pierluigi Reschiglian Lauree.
FACOLTA DI SCIENZE FF MM NN – TECNICHE SEPARATIVE – LMC FONDAMENTI DI SCIENZA DELLE SEPARAZIONI Scan lucido.
FACOLTA DI SCIENZE FF MM NN – TECNICHE ANALITICHE SEPARATIVE– LM Chimica FONDAMENTI DI SCIENZA DELLE SEPARAZIONI Scan lucido.
WESTERN BLOT VANTAGGI: le proteine sono più accessibili;
Corso di Laurea in Ottica e Optometria, Università di Padova
Fondamenti di Bioinformatica e di Biologia di sistemi (c.i. 18 CFU)
Ultimo aggiornamento: 7 aprile 2015 Facoltà di Scienze MM FF NN Insegnamenti Sbocchi Professionali Obiettivi formativi Presentazione CORSO DI LAUREA IN.
Flusso delle informazioni biologiche. In ogni istante della propria vita ogni cellula umana contiene: 46 cromosomi ( geni) mRNA diversi.
Mercoledì 29 Ottobre, Modugno, Attività settore ricerca e sviluppo  Messa a punto e produzione di bio-fertilizzanti.
Esercitazioni di Biochimica Applicata
Individuazione della causa di malattie e monitoraggio del decorso
PCR Scelta dello stampo Scelta dei primer.
Caratterizzazione di Proteine
Il DNA Trascrizione Traduzione Trascritto primario (pre-mRNA) mRNA
Università degli studi di Napoli “Federico II” Facoltà di Scienze MM. FF. NN. Progetto Lauree Scientifiche Cosa succede alle proteine quando vengono riscaldate?
Cenni di Bioinformatica
Facoltà di Farmacia Corso di laurea in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche Insegnamento di Microbiologia e Biologia animale.
Febbraio 2011 Laurea In Scienze e Tecnologie per l’Ambiente.
Ultimo aggiornamento: 19 luglio 2015 Facoltà di Scienze MM FF NN Insegnamenti Sbocchi Professionali Web e indirizzi Presentazione CORSO DI LAUREA IN SCIENZE.
POSTGENOMICA O GENOMICA FUNZIONALE
FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – LABORATORIO CHIMICA ANALITICA III CHIMICA BIOANALITICA Titolare: Barbara Roda Telefono: e_mail:
FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA BIOANALITICA CHIMICA BIOANALITICA Titolare: Barbara Roda Telefono: e_mail: Informazioni.
Chimica Analitica con Applicazioni Cliniche
FACOLTA’ DI MEDICINA – CHIMICA ANALITICA Chimica Analitica Crediti formativi: -2: lezioni frontali (28 ore) Obbiettivi del Corso: Fornire allo studente.
COS’E’ IL PROTEOMA? “PROTEins expressed in a functional genOMA”
Corso di Biologia Molecolare I Pagina web.
CROMATOGRAFIA Estrazione Ipotizziamo di avere due composti A e B A è solubile in acqua e insolubile in etere B è solubile in egual misura sia in acqua.
LABORATORIO 2: ANALISI DI RESTRIZIONE DI DNA GENOMICO In questa esercitazione campioni di DNA (es.: da fago λ e da plasmide pET28) verranno digeriti con.
PLS : PROGETTO LAUREE SCIENTIFICHE Referente: Prof.ssa Francesca Maiello Alunni partecipanti: Calderone Fabiana, Cataldo Francesco, Cotroneo Matilde, D’orzo.
Università degli Studi di Napoli “Federico II” Facoltà di Farmacia Corso di Biochimica e Biologia Molecolare - CQ.
III ESERCITAZIONE: PURIFICAZIONE DI IgG da una miscela proteica.
Elettroforesi Un processo mediante il quale molecole cariche si separano in un campo elettrico a causa della loro diversa mobilità m = K c/ M = mobilità.
I esercitazione II esercitazione III esercitazione IV esercitazione
ESTRAZIONE Esempi di metodologie LA PROCEDURA ADOTTATA DIPENDE:
Analisi Organica 1.TECNICHE DI ANALISI E SEPARAZIONE CROMATOGRAFICA Principi di base e classificazione delle tecniche cromatografiche: Un riepilogo. 
CROMATOGRAFIA L'invenzione della cromatografia viene attribuita al biochimico russo Mikhail Cvet che riuscì, nel 1906, a separare la clorofilla da un estratto.
Parte 5 Estrazione e quantificazione (Maggiore Iacovacci)
POSTGENOMICA O GENOMICA FUNZIONALE
Transcript della presentazione:

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE L’approccio genomico non tiene conto di modificazioni post-traduzionali

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE APPROCCIO PROTEOMICO

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PREFRAZIONAMENTO 1-Estrazione differenziale 2-Frazionamento subcellulare 3-Cromatografia

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PREFRAZIONAMENTO:ESEMPIO 1

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PREFRAZIONAMENTO:ESEMPIO 2

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PREFRAZIONAMENTO:ESEMPIO 3

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PREFRAZIONAMENTO:ESEMPIO

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE ANALISI PROTEOMICA: TECNOLOGIE

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE ELETTROFORESI BIDIMENSIONALE Efficace procedura di preparazione del campione Proteine denaturate e solubili (urea, Detergenti,…) 1° dimensione : Fino a 4 mg di proteine totali per strip Il campione viene comunementepre- adsorbito sulle strip durante la loro reidratazione, permettendo anche alle HMW proteins di entrare nel gel. Questo processo dura almeno 11 ore, dopodichè si può passare alla focalizzazione Durante la corsa elettroforeticala conduttività del gel cambia dipendentemente dal numero di specie cariche, diminuendo mano a mano che le varie specie si focalizzano. 2° dimensione: La transizione dalla prima alla seconda dimensione coinvolge l’equilibrazione della striscia focalizzata in tampone contenente SDS, la deposizione di essa sul gel di corsa e l’inglobamento in un gel di agarosio. COLORAZIONE

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE COLORAZIONE PROTEINE

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE COLLEGAMENTO A BANCHE DATI

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE COLLEGAMENTO A BANCHE DATI COMPARAZIONE CON 2D IN BANCA DATI

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE Detection of protein alterations in male breast cancer using 2D-gel electrophoresis and mass spectrometry.The involvement of several pathways in tmorogenesis K. Chahed et al. Clinica Chimica Acta (2007) ANALISI DIFFERENZIALE N=normale T=tumore

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE Detection of protein alterations in male breast cancer using 2D-gel electrophoresis and mass spectrometry.The involvement of several pathways in tmorogenesis K. Chahed et al. Clinica Chimica Acta (2007) ANALISI DIFFERENZIALE

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE ANALISI DEL GEL

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE IDENTIFICAZIONE DELLO SPOT

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE IDENTIFICAZIONE DELLO SPOT

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE IDENTIFICAZIONE DELLO SPOT

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE

TECNICHE MS E POTENZIALITA’

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PROTEIN MICROARRAY

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PROTEOMICA CON SELDI-TOF SELDI= Surface-Enanched Laser Desorption-Ionization Time-of-Flight Mass-Spectometer

FACOLTA’ DI SCIENZE FF MM NN – CHIMICA ANALITICA CON APPLICAZIONI CLINICHE PROTEOMICA CON SELDI-TOF