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1 PROGETTO SCoPE Incontro dei Progetti PON Avviso 1575 con il ROC di INFN Grid Catania 04/07/2008 Silvio Pardi.

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1 1 PROGETTO SCoPE Incontro dei Progetti PON Avviso 1575 con il ROC di INFN Grid Catania 04/07/2008 Silvio Pardi

2 2 Progetto SCoPE (Sistema Cooperativo distribuito ad alte Prestazioni per Elaborazioni Scientifiche Multidisciplinari) Progetto di Ateneo interamente dell’Università degli Studi di Napoli Federico II nell’ambito dei progetti PON avviso 1575/2004

3 3 Progetto SCoPE Comunità di riferimento Scienze del Microcosmo e del Macrocosmo Scienze della Vita Scienze dei materiali e dell’ambiente Analisi Numerica Scienze Sociali SCoPE serve nuove comunità prima non utilizzatrici del grid computing. Un unica VO di progetto scope, attualmente 60 iscritti, utilizzatori effettivi, continuo aumento.

4 4 Progetto SCoPE Optical Fiber SCIENZE MEDICINA LETTERE GIURISPRUDENZA INGEGNERIA Core. Collect

5 5 Progetto SCoPE Il progetto S.Co.P.E. prevede la creazione di una e-infrastruttura distribuita utilizzando il paradigma del Grid computing. Esso fornisce una risposta unitaria al problema del calcolo avanzato nell’ambito della Federico II, integrando tutte le principali risorse di calcolo e di storage già disponibli nei 4 siti di Medicina, Ingegneria, CSI e CAMPUSGRID, con un nuovo datacenter composto da hardware di utlima generazione. Tutte le sedi sono interconnesse tra loro ad alta banda mediante un anello in fibra ottica metropolitano.

6 6 Procurement Sito Primari, Nuovo CED Sito Secondario per le esigenze di bioinformatica Sito di Chimica, per scienzie dei materiali.

7 7 Il nuovo CED, il progetto INAUGURAZIONE AD OTTOBRE

8 8 Il nuovo CED, il progetto Ripartire da zero, non basarsi sul passato Nuova cabina elettrica 1 Mwatt Nuovo Gruppo Elettrogeno 1 Mwatt Raffreddamento ad acqua dei rack, con unità LCP e chiller esterno Rack a tenuta stagna Impianto antincendio interno ai rack Monitoraggio e telecontrollo Sensori su tutto (apertura porte rack, tensione di ogni presa, utilizzo ampere, etc)

9 9 Cabina elettrica da 1 MWatt

10 10 Il nuovo CED, il progetto Rack con raffreddamento Interno ad acqua Capacità 20 KW Per Rack

11 11 Il nuovo CED, il progetto RISORSE DEL NUOVO DATA CENTER: Circa 300 WN biprocessore quadcore a 64bit 8GB RAM, in soluzione blade,16 lame per shelf connessioni infiniband per un totale di oltre 2400 core Storage 150 TB raw via FC ed ISCSI 20 pizza box per servizi collective e nodi test connessioni FC 10 Storag Element connessioni FC 33 Rack Raffreddamento interno

12 12 Siti Secondari, il progetto RISORSE DEI SITI SECONDARI Dipartimento di Chimica Cluster 8 Nodi Quadriprocessore Dual-Core 32 GB per nodo Sito di Medicina Storage 50 TB raw via FC ed ISCSI

13 13 La rete LAN e WAN LAN Dorsale di rete a 10 Gbit/sec Rete ridondata (2x Gbit/sec, 4x Gbit/sec) Rete a bassa latenza (1x infiniband) Rete separata per monitoraggio e management (1x 100 Mbit/sec) WAN Collegamenti Intranet a 2.4 Gbit/sec, ridondati Collegamenti Internet a 1 Gbit/sec, ridondati

14 14 La rete LAN e WAN TIER2 ATLAS ISOLA SCoPE POP GARR CWDM Fibra Napoli-Portici ed Apparati GARR CRESCO-ENEA PORTICI

15 15 Il prototipo Sistema operativo SLC 3.0.8 i386 e SL 4.5 x86_64 Middleware di riferimento INFN-GRID nelle seguenti versioni: 3.0 Per i servizi Collective, CE ed SE Update 39 3.1 con SL 4.5 x86_64 per i Worker Node Update 12 Previsto passaggio a 3.1 di tutti i servizi a completamento del datacenter.

16 16 Il prototipo Torque+MAUI DPM su EXT3 Per il nuovo CED previsto, Torque+MAUI con più di un CE In studio la possibilità di utilizzare SToRM su Lustre o DPM su Lustre.

17 17 Stato del Prototipo SCoPE: Collective Services YAIM-REPOSITORY VOMS SERVER RESOURCE BROKER – BDII WMS GLITE MY-PROXY SERVER LFC – FILE CATALOG SERVER GRIDICE MONITORING HLR RESOURCE

18 18 Stato del Prototipo SCoPE: Core Services sito GSC COMPUTING ELEMENT 13 WORKER NODE 56 CORE STORAGE ELEMENT 4 TB SPAZIO DISCO USER INTERFACE GENIUS PORTAL

19 19 Stato del Prototipo SCoPE: Core Services VO ATTIVE scope cresco cybersar pi2s2 poncert CODE ATTIVE Scope (long, short, infinite) Cresco (long, short, infinite) Cybersar (long, short, infinite) Pi2s2 (long, short, infinite) Poncert - prioritaria Scopecert - prioritaria

20 20 Stato del Prototipo SCoPE: Core Services

21 21 Sistema di ticket SCOPE TICKET

22 22 Requirements degli Utenti Bioinformatica: Accessibilità allo storage, Certificati Robot Applicazioni di scienze dei materiali: Codice C, Fortran, Compilatori Intel, MPI su multi CPU o reti a bassa latenza. Applicazioni di Meccanica Statistica: Codice Fortran MPI anche su reti Ethernet. Astrofisica: Certificati Robot, Spazio UI. Applicazioni Materiali, Molecole nei Fluidi: Job Paralleli, Molta Memoria letture di Grosse Matrici, MPI. PET’S, MUMPS, METIS, PARDISO. Chimici: codice paralleo, SMP, MPI e non, libreie scientifiche Ingegneria Elettomagneti: IDL e paralleo. Ingeneria Elettrica: MPI Su Fortran Analis Numerica con applicazioni di Medical immaging.

23 23 SCoPE Tool Kit Toolkit di librerie scientifiche opensource installati mediante i comani lcg-asis. Disponibili per un certo numero di librerie job di Installazione Validazione Rimozione

24 24 SCoPE Tool Kit

25 25 SCoPE Tool Kit METIS MUMPS GROMACS FFTW3 FFTW2 GSL (GNU Scientific Library) BLAS (Basic Linear Algebra Subprograms) LAPACK (Linear Algebra PACKage) BLACS (Basic Linear Algebra Communication Subprograms) SCALAPACK (Scalable Linear Algebra PACKage) PETSc (Portable, Extensible Toolkit for Scientific Computation) PORT (Portable, Outstanding, Reliable, and Tested) CFITSIO PGPLOT SExtractor libX11 (Sottoinsieme di XFree86-libs) G95 Compilatori java, C, C++ IDL

26 26 SCoPE Network Monitoring IMPLEMENTAZIONE DI GLUEDOMAIN

27 27 Personale Coinvolto nella attività di SCoPE SCOPE Silvio Pardi spardi@na.infn.itspardi@na.infn.it Marco Scognamiglio marco.scognamiglio@unina.itmarco.scognamiglio@unina.it Davide Bottalico davide.bottalico@unina.itdavide.bottalico@unina.it Vania Boccia vania.boccia@unina.itvania.boccia@unina.it Fulvio Polito fulvio.polito@unina.itfulvio.polito@unina.it Anita Alicante anita.alicante@unina.itanita.alicante@unina.it Luca D’onofrio luca.donofrio@unina.itluca.donofrio@unina.it Gianluca Busiello gianluca.busiello@ceinge.unina.itgianluca.busiello@ceinge.unina.it Pasquale Caruso pasquale.caruso@unina.itpasquale.caruso@unina.it 8 persone 7 contrattisti sul progetto SCoPE.

28 28 Carico del Prototipo DICEMBRE GENNAIO APRILE GIUGNO

29 29 Job Processati dal prototipo

30 30 SETUP DEL PROTOTIPO 16 Core Gen-Mag 2007 UPGRADE PROTOTIPO 56 Core Giugn-Sett 2007 Dissemination Interna SCoPE + Attivazione Interop Sett-Dic 2007 Supporto Applicazioni Gen-Giugno 2008 Crescita degli utenti di SCoPE

31 31 SETUP DEL PROTOTIPO 16 Core Gen-Mag 2007 UPGRADE PROTOTIPO 56 Core Giugn-Sett 2007 Dissemination Interna SCoPE + Attivazione Interop Sett-Dic 2007 Supporto Applicazioni Gen-Giugno 2008 Crescita degli utenti di SCoPE


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