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Fenotipo Regolazione post-trascrizionale Regolazione post-traduzionale Citoplasma Proteina DNARNA Nucleo Regolazione trascrizionale Stabilità Trasporto.

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Presentazione sul tema: "Fenotipo Regolazione post-trascrizionale Regolazione post-traduzionale Citoplasma Proteina DNARNA Nucleo Regolazione trascrizionale Stabilità Trasporto."— Transcript della presentazione:

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2 Fenotipo Regolazione post-trascrizionale Regolazione post-traduzionale Citoplasma Proteina DNARNA Nucleo Regolazione trascrizionale Stabilità Trasporto Maturazione Traduzione Modificazione Modulazione funzionale

3 Double Dimension Protein Gel

4 Quantizzazione dellespressione genica REGOLAZIONE GENICA Durante lo sviluppo In risposta a stimoli ambientali DIAGNOSTICA Tessuti malati/tessuti sani Profili di espressione dei tumori Organizzazione del genoma Ibridazione genomica comparativa Immunoprecipitazione della cromatina Screening di mutazioni

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10 Total RNA Affinity purification mRNA Reverse transcription dNTP ( 33 P, Cy 3, Cy 5, Biotin)

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13 Affinity purification mRNA T7 promoter - poliT poliA Reverse transcription Transcription T7 promoter Random primer Labeling SIGNAL AMPLIFICATION DENDRIMERS cDNA

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15 Software: sovrapposizione e normalizzazione Marcatura radioattiva biotina IMMAGINE FINALE COMPUTERIZZATA ANALISI DEI DATI Microarrays NT IRR Controllo Condizione

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17 <<<<<<<<<<<<<<<<<< and less +3 and greater -1.99

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22 RNR4 HSP26 CUP1 ADH1 ERG5 28S HHF1 RNR2 RNR3 TTR1 K699 wt DMP1497/2b rad53 YLL150 rad NT

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24 CUP1 NT 0 15'30' 1h2h4h

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26 K-mean clustering

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41 DNA-protein Crosslink Lisi Frammentazione Immunopurificazione Identificazione DNA purificato

42 Transcriptional regulatory networks in Saccharomyces cerevisiae. Lee TI, Rinaldi NJ, Robert F, Odom DT, Bar-Joseph Z, Gerber GK, Hannett NM, Harbison CT, Thompson CM, Simon I, Zeitlinger J, Jennings EG, Murray HL, Gordon DB, Ren B, Wyrick JJ, Tagne JB, Volkert TL, Fraenkel E, Gifford DK, Young RA. Science 2002 Oct 25;298(5594):763-4

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