Interpretazione dei profili Parte 12a Esercitazioni: Interpretazione dei profili
Prova pratica: Interpretazione dei profili STR Esempio di profilo di buona qualità (Fusion 6C, parziale) Identificare: I bin allelici Il nome degli alleli Gli stutter L’intensità del segnale La lunghezza dell’amplicone Eventuali interalleli Delimitatori di locus Indicatori di qualità La tipologia di marcatori (STR? Autosomici , Y, X) Locus AMELX/AMELY
Prova pratica: Interpretazione dei profili Low template DNA
Prova pratica: Interpretazione dei profili Reazione fallita - Low template DNA?
Prova pratica: Interpretazione dei profili Non è un misto… è semplicemente il ladder allelico
Prova pratica: Interpretazione dei profili DNA degradato
Prova pratica: Interpretazione dei profili Eccesso di DNA stampo –segnali >30000 RFU Risulta in comparsa di picchi sovrannumerari dovuti a trasbordo cromatico (in D22 e D19), ed eventuale difetto di adenilazione (in FGA)
Prova pratica: Interpretazione dei profili Low template DNA; nota che il soggetto è un maschio Ma risulta come femmina in base al locus amelogenina
Prova pratica: Interpretazione dei profili Low template DNA, si noti: 1) RFU sotto 1000 (soglia stocastica) 2) Molti loci appaiono in omozigosi AMEL-X si perde
Prova pratica: Interpretazione dei profili AMELX null; D3S sbilanciato
Prova pratica: Interpretazione dei profili Mistura femmina maschio circa 3:1
Prova pratica: Interpretazione dei profili Eccesso di DNA stampo –segnali >30000 RFU Risulta in comparsa di picchi sovrannumerari dovuti a trasbordo cromatico vedi ad esempio TH01, (verde in giallo)
Prova pratica: Interpretazione dei profili Eccesso di DNA stampo –segnali >30000 RFU Risulta in comparsa di picchi sovrannumerari dovuti a trasbordo cromatico, vedi ad esempio TH01 e D18S51, (verde in giallo)
Interpretazione dei profili Prova pratica: Interpretazione dei profili Profilo di microsatelliti del cromosoma Y: Notare: Loci in emizigosi Loci multi-copy Problemi con sbilanciamento allelico?
Prova pratica: Interpretazione dei profili Profilo Y-STR, allele nullo al locus DYF387S1
Prova pratica: Interpretazione dei profili Profilo Y-STR, mutazione somatica (da 2 a 3 copie) sbilanciata al locus DYF387S1