Il DNA Trascrizione Traduzione Trascritto primario (pre-mRNA) mRNA

Presentazione sul tema: "Il DNA Trascrizione Traduzione Trascritto primario (pre-mRNA) mRNA"— Transcript della presentazione:

1 Il DNA Trascrizione Traduzione Trascritto primario (pre-mRNA) mRNA
cDNA Traduzione Precursore Proteina nativa

2 mRNA E SUE PRINCIPALI PROPRIETA’
L’mRNA prima di essere esportato nel citoplasma è sottoposto al processamento degli introni (splicing) e a modificazioni alle due estremità. L’RNA messaggero degli organismi eucariotici prima di essere esportato nel citoplasma è ampiamente modificato tramite il processamento delle sequenze introniche, non codificanti, e l’aggiunta all’estremità 5’ del CAP e al 3’ della coda di poly(A). Quest’ultima è una caratteristica molto importante per gli studi sull’espressione genica, essendo alla base di tutte le tecniche per lo studio dei trascritti genici.

3 The…OMICs technologies
LIVELLI di ANALISI DEFINIZIONE METODO GENOMA Set completo dei geni Sequenziamento del DNA TRASCRITTOMA mRNA di una cellula o di un tessuto EST, Arrays 2D Elettroforesi Mass. Spectr. (MS) PROTEOMA Set completo delle proteine Set completo dei metaboliti METABOLOMA Risonanza magnetica Spettrometria

4 The…OMICs technologies
LIVELLI di ANALISI DEFINIZIONE METODO Insieme dei fenotipi visualizzabili Popolazioni – progenie - mutagenesi Osservazione Misurazione Standardizzazione FENOTIPOMA INTERATTOMA Insieme delle interazioni proteina proteina di un sistema TWO-hybrid TAP (tandem affinity purification) Predictive interactomics

5 Functional Genomics gene by gene Sequenza FUNZIONE? “whole genome”
Dalla specie modello alla specie coltivata FUNZIONE

6 Gene by Gene Approach 1. Bioinformatics: Protein Identity
… 2. Expression Profiles (RT-PCR, Northern,…) 3. Gene Inactivation (antisense RNA, RNAi) 4. Ectopic expression (overexpression, …) 5. Interacting Proteins (immunoprecipitazione) 6. Protein localization (sub-cellular)

7 Whole genome Approach 1. Bioinformatics: Nucleotidic and Protein Identity 2. Expression Profiles (Microarray, gene-trap) 3. Gene Inactivation (TDNA Insertional mutagenesis, SALK) 4. Ectopic expression (activation-tagging …) 5. Interacting Proteins (TAP, two-hybrid) 6. Protein localization (sub-cellular)