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IL PROGETTO GENOMA UMANO (HGP) 2 metri di DNA; 2 metri di DNA; 46 cromosomi; 46 cromosomi; 3 MILIARDI di coppie di basi (A, T, C, G); 3 MILIARDI di coppie.

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2 IL PROGETTO GENOMA UMANO (HGP) 2 metri di DNA; 2 metri di DNA; 46 cromosomi; 46 cromosomi; 3 MILIARDI di coppie di basi (A, T, C, G); 3 MILIARDI di coppie di basi (A, T, C, G); GENI GENI

3 GENI E GENOMI 4000 (4.6x10 6 ) 6000 (1.2x10 7 ) (1.2x10 8 ) (2.6x10 9 ) N° geni (bp) Drosophyla m. Saccharomyces c. Escherichia c. Homo s

4 I GENI ERANO SEMPLICI IL PROGETTO PROTEOMA UMANO (HPP)… …I GENI ERANO SEMPLICI

5 Cosa si intende per PROTEOMA? Identifica TUTTE le PROTEINE espresse da un GENOMA in una cellula, un tessuto od organismo Definisce come queste proteine si organizzano in RETI di INTERAZIONE Descrive la STRUTTURA TRIDIMENSIONALE di queste proteine con lo scopo di poter identificare un FARMACO in grado di attivarne o disattivarne la funzione

6 La Proteomica nellera post-genomica

7 1)Identificazione delle proteine 2)Studio delle modificazioni post- traduzionali 3)Esame delle reti di interazioni proteina-proteina 4)Confronto differenziale tramite analisi bidimensionale 5)Determinazione della funzione 6)Medicina Molecolare

8 ANALISI BIDIMENSIONALE

9 Identificazione di proteine cellulari

10 C - Cellule Cristallino 7 cm, 3-10 pH, Ag Maldi - C Identificazione degli spots M H 2 O 2 (10 min) Control

11 Profilo di espressione proteica (H 2 O 2 vs ctrl)

12 500M H 2 O 2 (10 min) Controllo PrxI 310 pH 310 pH Stress Ossidativo come modello cellulare per lo studio della cataratta: IDENTIFICAZIONE DI PROTEINE SOGGETTE AL TRATTAMENTO

13 LA FUNZIONE DELLE PROTEINE NELLERA POSTGENOMICA CLASSICAPOST GENOMICA

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15 Identification of tumor markers from the study of Thyroid differentiation program THYROID DIFFERENTIATION THYROID CELL LINES: Normal vs transformed (different degree of differentiation NUCLEAR PROTEINS DNA-binding proteins, Co-activators, repressors, Transcriptional regulators 2-D GEL ANALYSIS Expression Proteomics Cell Mapping Proteomics Differential global pattern analysis Intermolecular Networks (GST-Pulldown, IP) MALDI-MS Identification (CNR Naples) PROTEIN of INTEREST MOLECULAR MODEL (in vitro and in vivo assays) TUMORAL TISSUES (Thyroid and other) Tumoral marker)


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